北京基因組所開發完成DNA甲基化重編程數據庫
DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記，在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用，不同物種所采用的機制亦各不相同。因而，整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析，可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異，并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。 中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室章張研究組、劉江研究組以及所級中心信息室組成的開發團隊，在研究所高性能計算平臺和大數據存儲平臺的有力支撐下，共同開發完成“基于高通量測序的單堿基精度DNA甲基化重編程數據庫MethBank”，該成果于2014年10月在國際生物信息學領域期刊Nucleic Acids Research 在線發表。 MethBank是面向多種模式生物配子和早期胚胎多個不同發育時期的DNA甲基化組重編程數據庫，整合的數據包括甲基化水平、差異甲基化區域、CpG島甲基化水平等，全部是全基因組單堿基精度的D......閱讀全文
美國更新食品摻假數據庫
9月5日食品安全新聞網消息，美國藥典委員會（USP）更新了食品摻假數據庫（FFD2.0）。食品摻假數據庫主要為行業、監管部門以及消費者預防和應對食品摻假事件發生提供技術支持。最新的FFD2.0涵蓋了科研文獻、媒體信息、食品監管記錄、司法裁決記錄中涉及食品摻假事件的各種信息。新版食品摻假數據庫將于
拉曼光譜免費數據庫
拉曼數據庫在物質鑒定和化學分析方面具有重要的作用。關于拉曼數據，我們一般會關注兩個峰的位置，分別是D峰和G峰。D峰和G-峰均是C原子晶體的 Raman特征峰，分別在1350cm-1和 1580 cm-1附近，D峰反應的是晶格的碳缺陷，G峰反應的是材料的碳化程度。I(D) / I(G) 是 D峰和G峰
lncRNA啟動子DNA甲基化/羥甲基化測序分析綜述
技術優勢： ● 專注非編碼RNA領域，完善的lncRNA啟動子分析流程 ● 可與lncRNA表達譜芯片聯合應用，實現平臺間無縫對接 ● 可視化數據展示，提供paper級結果圖表 ● 優化的IP實驗方法，可信賴的檢測平臺及數據結果 介紹： 人類基因組中僅有
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
甲基化的檢測方法
(1) 甲基化特異性的PCR（Methylation-specific PCR，MSP）用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA，所有未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不變；隨后設計針對甲基化和非甲基化序列的引物進行PCR。通過電泳檢測MSP擴增產物，如果用針對處理后甲基化DNA鏈的引物能得到
甲基化熒光PCR檢測
?甲基化熒光檢測(methylight)是利用熒光定量性PCR檢測亞硫酸氫鈉處理后的序列改變。在TaqManR技術中，可以使用3種不同的單核苷酸(正義引物、反義引物和熒光雜交探針)，進行不同序列的檢測。與已存在的技術相比，甲基化熒光檢測最明顯的優點就是能同時對幾百甚至幾千例樣品迅速檢測。???? 高
什么是DNA甲基化？
DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基化轉移酶的作用下，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5號碳位共價鍵結合一個甲基基團。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色質結構、DNA構象、DNA穩定性
甲基化研究新套路
組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向，然而傳統甲基化研究一般分四步走：尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。 為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制，上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士課
DNA甲基化的原理
DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DNA methyltransferase，DNMT）的催化作用下，以S—腺苷甲硫氨酸（S—adenosyl methionine，SAM）作為甲基供體，通過共價鍵結合的
甲基化干擾實驗用途
應用這種技術可以檢測靶DNA中G殘基的優先甲基化，對爾后的蛋白質結合作用究竟會有什么效應，從而更加詳細的揭示出DNA與蛋白質相互作用的模式。
甲基化的類型介紹
甲基化包括DNA甲基化和蛋白質甲基化。（1）DNA甲基化：脊椎動物的DNA甲基化一般發生在CpG位點（胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤位點，即DNA序列中胞嘧啶后緊連鳥嘌呤的位點）。經DNA甲基轉移酶催化胞嘧啶轉化為5-甲基胞嘧啶。人類基因中約80%-90%的CpG位點已被甲基化，但是在某些特定區域，如富含胞嘧
甲基化研究新思路
????????組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向，然而傳統甲基化研究一般分四步走：尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制，上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士
LightCycler應用：甲基化分析
主要應用:應用實時熒光PCR技術進行快速準確的DNA甲基化分析DNA甲基化是表觀遺傳學的重要研究內容之一，它可以在轉錄水平抑制基因的表達。具體的過程是在胞嘧啶－鳥嘧啶（CpG二核苷酸）的5位碳原子上添加了一個額外的甲基團，形成5－甲基胞嘧啶。CpG二核苷酸密度較高的區域在人體基因組中呈非隨機分布于，
關于甲基化的釋義
甲基化是指從活性甲基化合物上將甲基催化轉移到其他化合物的過程。可形成各種甲基化合物，或是對某些蛋白質或核酸等進行化學修飾形成甲基化產物。在生物系統內，甲基化是經酶催化的，這種甲基化涉及重金屬修飾、基因表達的調控、蛋白質功能的調節以及核糖核酸加工。
甲基化熒光PCR檢測
?????? 甲基化熒光檢測（methylight）是利用熒光定量性PCR檢測亞硫酸氫鈉處理后的序列改變。在TaqManR技術中，可以使用3種不同的單核苷酸（正義引物、反義引物和熒光雜交探針），進行不同序列的檢測。與已存在的技術相比，甲基化熒光檢測zui明顯的優點就是能同時對幾百甚至幾千例樣品迅速檢
甲基化檢測方法介紹
(1) 甲基化特異性的PCR（Methylation-specific PCR，MSP）用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA，所有未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不變；隨后設計針對甲基化和非甲基化序列的引物進行PCR。通過電泳檢測MSP擴增產物，如果用針對處理后甲基化DNA鏈的引物能得到
DNA甲基化技術介紹
DNA 甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用，是目前新的研究熱點之一。介紹DNA甲基化是最早被發現、也是研究最深入的表觀遺傳調控機制之一。廣義上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的堿基在DNA甲基轉移酶（DN
甲基化的主要類型
（1）DNA甲基化：脊椎動物的DNA甲基化一般發生在CpG位點（胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤位點，即DNA序列中胞嘧啶后緊連鳥嘌呤的位點）。經DNA甲基轉移酶催化胞嘧啶轉化為5-甲基胞嘧啶。人類基因中約80%-90%的CpG位點已被甲基化，但是在某些特定區域，如富含胞嘧啶和鳥嘌呤的CpG島則未被甲基化。這與
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作為最新的國自然熱點受到
甲基化研究新套路
組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向，然而傳統甲基化研究一般分四步走：尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。 為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制，上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士課
研究開發表觀組關聯分析數據庫
近日，由中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心開發的人類表觀組關聯分析數據庫EWAS Data Hub正式上線。該項研究成果以EWAS Data Hub： a resource of DNA methylation array data and metadata 為題在國際學術期刊《核
科學家實現單細胞水平甲基化和去甲基化調控
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507595.shtm
檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品，已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者，云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商，首發推出了非編碼RNA甲基化測
快速檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平
占領C位！云序生物解析如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平 RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品，已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者，云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商，首發推出了非編碼RNA
最新進展：RNA的甲基化與去甲基化修飾
德國慕尼黑的路德維希-馬克西米利安大學（LMU）研究人員發現了細菌RNA中一種新型的化學修飾形式。顯然，只有當細胞處于應激狀態時，這種修飾才會附著在分子上，并且在恢復過程中會迅速去除。 核糖核酸（RNA）在化學形式上與DNA密切相關，而DNA是所有細胞中遺傳信息的載體。實際上，RNA本身在將遺
同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品，已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者，云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商，首發推出了非編碼RNA甲基化測序研究，首發推出了超微量RNA甲基化測序技術，首發推出RNA甲基化研究一站式系統性解決方案，云
檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物課堂開講時間！你，準備好了嗎？ 上一期文章當中，云序通過引用這樣一張表格給大家傳遞了一個重要信息：表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶，而且這些酶在不同疾病當中意義有所不同，例如METTL3在AML、B
表觀遺傳研究指南（二）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
北京基因組所開發表觀組關聯分析數據庫
近日，由中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心開發的人類表觀組關聯分析數據庫EWAS Data Hub正式上線。該項研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 為題在國際學術期刊《核
NCBI－GenBank數據庫的起源、功能和常遇問題及解答
GenBank數據庫功能為一、提交獲取的基因序列；二、查找已知基因的序列生物學特性信息，例如編碼區，科學命名等。那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢？ GenBank數據庫起源 GenBank數據庫是1982年由美國國立生物技術信息中心(NCBI)建