DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記，在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用，不同物種所采用的機制亦各不相同。因而，整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析，可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異，并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。
中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室章張研究組、劉江研究組以及所級中心信息室組成的開發團隊，在研究所高性能計算平臺和大數據存儲平臺的有力支撐下，共同開發完成“基于高通量測序的單堿基精度DNA甲基化重編程數據庫MethBank”，該成果于2014年10月在國際生物信息學領域期刊Nucleic Acids Research 在線發表。
MethBank是面向多種模式生物配子和早期胚胎多個不同發育時期的DNA甲基化組重編程數據庫，整合的數據包括甲基化水平、差異甲基化區域、CpG島甲基化水平等，全部是全基因組單堿基精度的DNA甲基化數據，且集成了其它包括基因表達信息、SNP信息等在內的相關組學數據信息。此外，MethBank提供一個支持多組學數據的交互式甲基化瀏覽器，能夠高分辨度地實現DNA甲基化圖譜以及其它相關數據的可視化。
MethBank現今整合集成了斑馬魚和小鼠各自9個不同發育時期的全基因組單堿基精度DNA甲基化數據，每個時期包含全基因組約90%CG位點的甲基化信息，且對應的數據庫表存有上千萬條記錄，數據庫存儲大小分別為15G和9G。MethBank的開發建立實現了海量甲基化大數據的整合與可視化，為后續其它多個物種的大數據整合提供了流程方法和數據平臺。
該項研究得到了中國科學院、科技部和國家自然科學基金委的資助。
數據庫頁面
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