我國科學家開發高質量基因組組裝軟件
11月25日,中國科學院遺傳與發育生物學研究所梁承志研究組開發的高質量基因組組裝軟件HERA在《自然-通訊》在線發表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。論文題目為Assembly of chromosome-scale contigs by efficiently resolving repetitive sequences with long reads。 高質量基因組序列對于研究一個物種基因組的結構、功能、進化、基因定位和克隆等都至關重要。目前單分子測序技術的發展,已使得構建高質量基因組草圖越來越容易。然而,這些草圖序列仍然存在著由于組裝序列碎片化而導致的多種錯誤,比如不完整的基因序列、排列到染色體上之后的片段遺漏、排列順序錯誤和方向錯誤等。這些錯誤對于利用這些基因組所做的很多研究會造成不便或誤導。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所梁承志組多年......閱讀全文
新軟件按需組裝無縫基因組序列
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?(記者張夢然)美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具,用于組裝來自各種物種的真正完整(即無縫)的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭
大大加速基因組分析的新軟件
最近,新加坡科技研究局(A*STAR)基因組研究所(GIS)和生物信息學研究所(BII)的科學家帶領的一個國際研究小組,開發出了一種可以加快基因組分析的軟件——SIFT 4G(SIFT for Genomes)。這項研究結果發表在《Nature Protocols》雜志。 基因組測序可幫助我們
我國科學家開發高質量基因組組裝軟件
11月25日,中國科學院遺傳與發育生物學研究所梁承志研究組開發的高質量基因組組裝軟件HERA在《自然-通訊》在線發表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。論文題目為Assembly of chromosome-scale c
細胞器基因組組裝軟件開發研究獲進展
真核生物細胞器基因組包括線粒體和質體(包括葉綠體、白色體等)的全部DNA分子,是細胞質遺傳的主要載體。在動植物和真菌的單個細胞內,有多個(甚至成千上萬個)細胞器基因組單元的拷貝,使得利用低覆蓋度的全基因組測序數據組裝得到完整的細胞器基因組成為可能。隨著DNA高通量測序技術的發展,測序成本下降,低
中國科學家開發出高質量基因組組裝軟件
高質量基因組序列對于研究一個物種基因組的結構、功能、進化、基因定位和克隆等都至關重要。目前單分子測序技術的發展,已使得構建高質量基因組草圖越來越容易。然而,這些草圖序列仍然存在著由于組裝序列碎片化而導致的多種錯誤,比如不完整的基因序列、排列到染色體上之后的片段遺漏、排列順序錯誤和方向錯誤等。這些
如何使用-geNorm-軟件評估多內參基因組合的穩定性?
使用 geNorm 軟件評估多內參基因組合的穩定性,一般按照以下步驟進行:準備數據:首先,您需要從實驗中獲得多個內參基因在不同樣本中的定量 PCR 數據,通常是以 Ct 值(循環閾值)的形式。數據輸入:打開 geNorm 軟件,將準備好的數據按照軟件要求的格式輸入。軟件分析:軟件會計算每個內參基因的
美國科學家開發出快速精準腫瘤基因組分析軟件
美國 Mayo Clinic的研究人員設計了一款可識別腫瘤基因改變的軟件——BIMA V3(Binary Indexing Mapping Algorithm,version 3),比其他常用基因測序程序速度快20倍,準確度高25%。 成對測序技術是一種復雜的昂貴的技術,可用
有哪些其他軟件可以評估多內參基因組合的穩定性?
以下是一些可以評估多內參基因組合穩定性的其他軟件:NormFinder:能夠同時考慮組內和組間變異,評估單個內參基因和多個內參基因組合的穩定性。BestKeeper:通過分析基因的標準差、變異系數和相關系數等參數來評估內參基因的穩定性。RefFinder:綜合了上述幾種軟件(如 geNorm、Nor
我國學者研究的高質量基因組組裝軟件在Nature子刊發表!
中國科學院遺傳與發育生物學研究所梁承志研究組開發的高質量基因組組裝軟件HERA在《自然-通訊》在線發表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。論文題目為Assembly of chromosome-scale contigs
酒精測試儀軟件的你軟件概述
酒精測試儀是一款手機上的生活類軟件,根據用戶所輸入的飲酒信息,及時測試車主血液酒精濃度,進而提示所處的“醉酒駕駛”、“飲酒駕駛”、“安全駕駛”狀態,并提醒不同狀態下距離安全駕駛所需的時間。
感官仿真軟件
上海瑞玢-SS301-感官仿真軟件(質構儀、電子鼻、電子舌、電子眼)型號:SS301品牌:瑞玢產地:上海SS301-感官仿真軟件簡介智能感官儀器仿真(電子鼻、電子舌、電子眼):在虛擬的實驗室場景中,有儀器主機,進樣機,傳感器,VC版軟件操作站,相關設備與真實設備相符,如設備的顏色、設備的形狀;同時將
熔點測定軟件
提升實驗臺性能熔點測定軟件具有什么功能? 如今,分析儀器不僅會提供準確的結果: 還應確保數據安全性并優化工作流程。 使用LabX實驗室軟件符合FDA 21 CFR Part 11等法規要求。 輕松管理用戶、方法、結果和調整。 平滑無縫地執行復雜的工作流程。 提供多種曲線和視頻,報告可以個性化
熔點測定軟件
提升實驗臺性能熔點測定軟件具有什么功能? 如今,分析儀器不僅會提供準確的結果: 還應確保數據安全性并優化工作流程。 使用LabX實驗室軟件符合FDA 21 CFR Part 11等法規要求。 輕松管理用戶、方法、結果和調整。 平滑無縫地執行復雜的工作流程。 提供多種曲線和視頻,報告可以個性化
MassARRAY?-分析軟件
MassARRAY??分析軟件是一套模塊化應用程序,用于基因分型、甲基化、基因表達、拷貝數變異等多種應用的數據分析。以MassARRAY??Typer4軟件為例,該軟件用于MassARRAY系統的iPLEX? SNP基因分型。用戶可利用它進行分析結果的評估和管理,通過表格和圖形格式進行數據的可視化,
酶標儀軟件功能
? ? ? 軟件功能是指酶標儀所具有的對ELISA定性和定量測定及其他測定方式如酶標動力學、紫外和凝集等數據的統計分析并報告結果的功能。軟件功能是中高檔酶標儀的一個非常重要的功能。如果硬件方面區別不大,則軟件就成為判定酶標儀優劣的惟一指標。對于用戶來說,好的軟件功能,對實際工作會有較大的幫助。ELI
葛峰課題組最新文章發布原核生物的蛋白基因組分析軟件
蛋白基因組學(Proteogenomics) 是基于高精度的串聯質譜數據對基因組進行注釋,不僅能在蛋白質水平上驗證基因表達和模式,還能提供蛋白質組層面特有的信息,如翻譯后修飾、信號肽等,目前 已成為功能基因組學研究不可或缺的重要工具。然而,對海量質譜數據實現全面和精準的解讀仍是當前蛋白基因組學研
ASP感官分析軟件汽配行業專用感官分析軟件
1.ASP-汽配行業專用感官分析軟件簡介ASP-汽配行業專用感官分析軟件是一款為開展規范的汽車氣味感官評價活動開發的計算機管理軟件。軟件的主體功能是感官檢驗模塊,可實現感官檢驗試驗設計、結果錄入、結果分析、報告輸出的在線自動化。采用全球及全國范圍內普遍認可、協調一致的感官分析標準化方法,按照VW50
工業軟件前景可期
工業軟件是制造業數字化轉型的關鍵支撐,對于很多現代制造業行業來說,從源頭開始就離不開工業軟件。據統計,2022年,我國工業軟件產品實現收入2407億元,同比增長14.3%。 近年來,圍繞服務國家戰略,重慶大力引進培育工業軟件企業。門類齊全的制造業,龐大的用戶群體,豐富的應用場景,旺盛的市場需求
定制標簽打印軟件
? ? ? ?定制標簽打印軟件產品介紹條碼技術做為一種信息載體,它的出現在很大程度提高了生產效率,同時也減輕了工人的負擔,提高了生產效率。在實際生產中,標簽的打印在各行各業的應用都十分廣泛。每家企業所需要打印的標簽也是多種多樣的。例如在產品裝箱或者進行稱重檢測、功能檢測后,需要打印一張OK或NG標簽
iC-Data-Center-軟件
iC Data Center 軟件采集、制備、共享實驗數據 大約有 85% 的實驗室數據丟失,原因是數據未由實驗儀器傳送,或者未作任何記錄。iC Data Center 可確保從本地儀器中自動采集所有實驗數據,將其制備成有用格式,然后在中央文件存儲設備上共享,從而簡化研究人員及其同事的日常工作。iC
影像儀測量軟件
影像儀軟件是影像儀的數據處理中心。通過影像探測系統拍攝到工件圖像后,圖像數據傳入計算機,由測量軟件進行各種幾何要素的測量以及數據分析。影像儀軟件提供人機交互的界面。操作人員通過測量軟件觀測待測工件、設置檢測狀態、輸入輸出數據、控制影像測量儀工作臺運動、對數據進行分析。對于自動影像測量儀,測量軟件
操作軟件WINDOX介紹
通過軟件來控制儀器的自動運行和測試:利用鼠標按下啟動按鈕,在短短的幾秒內就可以完成整個測試過程并給出測試報告,極其快捷和方便地進行重復測試; ? 數據庫中儲存原始測試數據,根據需要隨時調出并選用不同模板生成不同格式的報告,用戶可自定義模板格式; ? 結果輸出:粒度分布、顆粒
XRD相關分析軟件
1)pcpdfwin屬于第二代物相檢索軟件。它是在衍射圖譜標定以后,按照d值檢索。一般可以有限定元素、按照三強線、結合法等方法。所檢索出的卡片多數時候不對。一張復雜的衍射譜有時候需要花幾天的時間。2)search match一個專門的物相檢索程序,屬于第三代檢索軟件,采用圖形界面,根據圖譜實體來對譜
PCB設計軟件介紹
之前我們討論過DFM,了解了PCB設計的重要性。那么,主流的PCB設計軟件有哪些呢?我們分為免費軟件、適合設計低端PCB板的軟件,以及適合設計高端PCB板的軟件,大致分為三類,給大家簡單介紹。一、免費軟件1、ZentiPCBZentiPCB是一個基于CAD的程序,允許用戶導入網表文件和使其圖
輕松感官分析軟件
CSAS-輕松感官分析軟件簡介CSAS-輕松感官分析軟件是一款為開展規范的感官評價活動開發的計算機管理軟件。軟件的主體功能是感官檢驗模塊,可實現感官檢驗實驗設計、結果錄入、結果分析、報告輸出的在線自動化。采用在全球及全國范圍內普遍認可、協調一致的感官分析標準化方法,按照感官分析國際標準(ISO)和我
KSV-NIMA-LB軟件
KSV NIMA LB軟件非常直觀,操作簡單方便。它為客戶提供了涵蓋經典的Langmuir及Langmuir-Blodgett膜實驗在內的各種預編程序。這些程序可根據用戶的需求自行修改,可記錄大量的數據及參數,并對相關數據進行作圖分析。可記錄的參數包括數據點的數目、時間、滑障位置、滑障速度、槽體面積
工業軟件前景可期
工業軟件是制造業數字化轉型的關鍵支撐,對于很多現代制造業行業來說,從源頭開始就離不開工業軟件。據統計,2022年,我國工業軟件產品實現收入2407億元,同比增長14.3%。 近年來,圍繞服務國家戰略,重慶大力引進培育工業軟件企業。門類齊全的制造業,龐大的用戶群體,豐富的應用場景,旺盛的市場需求
常用生物軟件介紹
一、Microarray軟件1. Array Designer 4.25 Build 42501,為微陣列批量設計cDNA引物和寡核苷酸引物的工具,適用于Windows和Linux系統。斯坦福編寫的軟件系列:2. ScanAlyze,Microarray圖像分析軟件,從單一或雙色熒光雜交產生的熒光圖
常用化學軟件大全
化學結構式有關化學結構式編輯的軟件市面上非常之多,它們各有所長。既有商品的,亦有對教育界及家用免費的。其功能主要是描繪化合物的結構式、化學反應方程式、化工流程圖、簡單的實驗裝置圖等化學常用的平面圖形的繪制。常見的這類軟件有:ChemDraw, ChemWindow, ISIS Draw, C
STARe熱分析軟件
功能強大的多用途STARe軟件具有獨特的靈活性及無限的數據評估可能性。STARe軟件是堅持不懈開發的結果,以“提高性能、滿足全球客戶需求”為目標。無限的數據評估可能性-極大的的靈活性可靠的自動化 — 帶結果評估的高樣品量極大地提高了效率集成式數據庫-確保了最高程度的數據安全性免費的STARe評估軟件