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  • 以胞苷脫氨酶為基礎構建出多種新型的CBE工具

    8月9日,《自然-通訊》雜志在線發表了題為《多種胞苷脫氨酶為基礎擴展的C-T單堿基編輯工具》的研究論文。該研究由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心/神經科學研究所、上海腦科學與類腦研究中心、神經科學國家重點實驗室仇子龍研究組與復旦大學中山醫院教授王小林實驗室合作完成。該研究以新的胞苷脫氨酶為基礎構建出多種新型的CBE工具。與傳統CBEs相比,新型CBEs的單堿基編輯窗口更加多樣化,脫靶風險也顯著降低,這為C/G-T/A單堿基編輯技術的更廣泛應用提供了有力工具。 CRISPR/Cas9技術的誕生讓高效基因編輯成為可能,但同源重組介導的精準基因編輯效率有限,限制了該技術的廣泛應用。2016年以來,研究者發現將堿基脫氨酶(如胞苷脫氨酶APOBEC1及腺苷脫氨酶TadA變體)與CRISPR/Cas系統整合開發出的單堿基編輯系統,可在不切斷DNA雙鏈的情況下精準引入C/G-T/A及A/T-G/C點突變,從而實現高效精準的基因編輯......閱讀全文

    單堿基基因編輯技術之工具篇

      前言   今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展

    單堿基基因編輯技術之工具篇

      今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展壯大的歷程!

    單堿基基因編輯技術之工具篇

    前言今年5月,David R. Liu教授與張鋒教授等人聯合創立Beam Therapeutics公司,再一次將“單堿基編輯技術”送上了熱搜榜,趁著熱度還未散去,我們繼上一期“單堿基編輯技術淺談”后,又為大家準備了一篇超級實用性的深度分析,帶你一起看看單堿基編輯的前世今生及如何一步步發展壯大的歷程!

    以胞苷脫氨酶為基礎-構建出多種新型的CBE工具

      8月9日,《自然-通訊》雜志在線發表了題為《多種胞苷脫氨酶為基礎擴展的C-T單堿基編輯工具》的研究論文。該研究由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心/神經科學研究所、上海腦科學與類腦研究中心、神經科學國家重點實驗室仇子龍研究組與復旦大學中山醫院教授王小林實驗室合作完成。該研究以新的胞苷脫氨酶為

    人工智能的蛋白結構聚類分析,發現新的堿基編輯器

      在一項新的研究中,中國科學院遺傳與發育生物學研究所的高彩霞(Gao Caixia)課題組率先使用人工智能(AI)輔助的方法,通過結構預測和分類發現具有獨特功能的新型脫氨酶蛋白。這種方法為發現和構建理想的植物遺傳性狀開辟了一系列的應用。相關研究結果于2023年6月27日在線發表在Cell期刊上,論

    DNA堿基編輯:基因編輯工具“升級版”

      美國哈佛大學14日宣布,將授予光束療法(Beam Therapeutics,下稱BT)公司全球ZL許可,對可用于治療人類疾病的一套革命性DNA堿基編輯技術進行開發和商業化。  BT公司同日宣布,已經籌集了高達8700萬美元由F-Prime資本和ARCH風投牽頭的A輪融資。BT公司由基因編輯技術領

    DNA堿基編輯:基因編輯工具“升級版”

      美國哈佛大學14日宣布,將授予光束療法(Beam Therapeutics,下稱BT)公司全球ZL許可,對可用于治療人類疾病的一套革命性DNA堿基編輯技術進行開發和商業化。   BT公司同日宣布,已經籌集了高達8700萬美元由F-Prime資本和ARCH風投牽頭的A輪融資。BT公司由基因編輯技

    方興未艾:單堿基基因編輯技術

      近一年多來,全世界范圍內多個實驗室圍繞“單堿基基因編輯技術”發表了大量的研究成果,而我國科學在此領域也取得了一系列重要進展。特別是近日,來自中山大學松陽洲和黃軍就實驗室在Protein & Cell雜志上發表了題為“Effective gene editing by high-fidelity

    我國科學家開發更高精度的單堿基基因編輯工具

      單堿基編輯技術是一種是自2012年CRISPR/Cas9技術被發現以來最寄予厚望的高精度基因編輯技術,其中一種單堿基編輯技術BE3可以在不切斷DNA雙鏈的情況下精確地引入由C/G到T/A的點突變,另外一項單堿基編輯技術ABE7.10可以由T/A突變成C/G的技術,對于基因突變導致的遺傳疾病的治療

    利用單堿基編輯器實現多位點單堿基編輯DMD及HGPS豬模型

      6月28日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在國際學術期刊Nature Communications(《自然-通訊》)發表了題為Efficient base editing for multiple genes and loci in pigs using base editors

    基因編輯大牛Nature子刊發文:CRISPR單堿基編輯準確!

      來自韓國基礎科學研究所IBS的研究人員發表了題為“Genome-wide target specificities of CRISPR RNA-guided programmable deaminases”的文章,證實了最近研發的基因編輯方法的準確性。這一研究成果公布在4月10日的Nature

    單堿基基因編輯研究進展速覽

      本文中,小編整理了近年來科學家們在單堿基基因編輯研究領域取得的新進展,分享給大家!  【1】Nat Commun:科學家首次在豬身上實現多位點單堿基編輯  doi:10.1038/s41467-019-10421-8  近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組利用單堿基編輯器首次在豬

    CRISPR技術再升級——單堿基的精準編輯

      CRISPR/Cas9基因組編輯系統來源于簡單的細菌免疫系統組分,經過改造后可在真核細胞中實現高度靈活且特異的基因組編輯。該系統是單RNA(single-guide RNA, sgRNA) 介導的核酸酶系統,通過靶點特異的CRISPR RNA (crRNA)序列與靶序列進行堿基配對從而引導Cas

    不依賴脫氨酶的堿基編輯器開發成功

      記者1月14日從中國科學院天津工業生物技術研究所獲悉,該所研究員畢昌昊團隊和研究員張學禮團隊合作開發了不依賴脫氨酶(DAF)的新型堿基編輯器。該成果擴展了堿基編輯器的類型,為工業菌株改造和生物醫藥等領域研究提供了新的技術工具。相關研究成果近日發表于國際期刊《自然-生物技術》。  堿基對是形成DN

    非脫氨酶依賴的嘧啶堿基編輯器TBE獲得進展

      DNA堿基編輯工具的進步為疾病治療帶來了巨大的希望,可修復由單核苷酸多態性(SNPs)【1】引起的單基因遺傳疾病。目前,胞嘧啶堿基編輯器和腺嘌呤堿基編輯器主要依靠脫氨酶將胞嘧啶(C)或腺嘌呤(A)轉化為尿嘧啶(U)或肌苷(I),脫氨后的U和I會分別被識別為胸腺嘧啶(T)和鳥嘌呤(G),從而促進C

    天津工生所實現單窗口堿基編輯

      堿基編輯器主要有3種類型:胞嘧啶堿基編輯器(cytosine base editor, CBE)、腺嘌呤堿基編輯器(adenine base editor, ABE)和糖基化酶堿基編輯器(Glycosylase base editor,GBE),它們在不需要DNA雙鏈斷裂和編輯模板的情況下可分別

    單堿基編輯首次應用于非人靈長類模型

    ? ?5月20日美國遺傳學家團隊近日首次在非人靈長類模型中,實現了對一種名為PCSK9基因剪接位點的高效精準編輯。這一成功意味著,只需單次注射,便可持久抑制肝臟中PCSK9基因的表達,其為心血管疾病的預防提供了全新的思路,并極大地推動了單堿基編輯技術的臨床轉化應用。研究報告19日公開于英國《自然》雜

    科學家找到基因治療新利器

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503037.shtm6月16日,華東師范大學生命科學學院教授李大力團隊在《自然-生物技術》發表論文,報道了一系列新型腺嘌呤顛換編輯工具(AXBEs和ACBEs),并證明了ACBEs在不同細胞系與小鼠胚胎中

    基因編輯進展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技術應用篇(一)

    前言:近年來,CRISPR基因編輯技術正在席卷整個生物醫學研究領域,上一期我們已先從CRISPR系統開發及機制研究方面梳理了2018年相關大事件。伴隨著基礎技術不斷優化,CRISPR技術的應用也更加廣泛,如動物造模、藥物篩選、單堿基編輯技術、細胞譜系示蹤、基礎疾病研究、疾病診斷、體內編輯和遺傳病校正

    AI輔助創新蛋白聚類方法開發新型堿基編輯工具

      中國科學院遺傳與發育生物學研究所高彩霞研究組開創性地運用AI輔助結構預測,建立起基于三級結構的蛋白聚類方法,并擴展為全新的脫氨酶挖掘體系,開發了一系列具有中國自主知識產權的新型堿基編輯工具。該工作為蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研發的堿基編輯系統具有我國自主知識產權的精準基因編輯

    利用改進的CRISPR/Cas9系統高效和特異性地實現單堿基突變

      在一項新的研究中,利用一種引入DNA單個核苷酸變化的脫氨酶,來自日本神戶大學的研究人員構建出一種改進的CRISPR/Cas9工具,從而避免產生有害的雙鏈斷裂,使得利用CRISPR/Cas9技術引入的附帶突變最小化,而且也不需要加入DNA模板。相關研究結果于2016年8月4日在線發表在Scienc

    高彩霞團隊開發出不依賴CRISPR的全新堿基編輯工具

      基因組編輯可以對生物體遺傳信息進行精準、高效的修飾,已成為生命科學領域的一項顛覆性技術。通過融合nCas9(切口酶形式的Cas9)與脫氨酶,美國哈佛大學David Liu團隊先后開發出胞嘧啶堿基編輯系統(Cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤堿基編輯系統(Adenine ba

    基因編輯進展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技術應用篇(上)

      前言:近年來,CRISPR基因編輯技術正在席卷整個生物醫學研究領域,上一期我們已先從CRISPR系統開發及機制研究方面梳理了2018年相關大事件。伴隨著基礎技術不斷優化,CRISPR技術的應用也更加廣泛,如動物造模、藥物篩選、單堿基編輯技術、細胞譜系示蹤、基礎疾病研究、疾病診斷、體內編輯和遺傳病

    世界首次證實單堿基基因編輯存在脫靶效應

      基因編輯技術越來越火,然而針對基因編輯工具最大的風險——脫靶效應,一直以來缺乏良好的檢測工具。記者從中科院神經科學研究所獲悉,其團隊與多家機構合作完成的研究,建立了一種在精度、廣度和準確性上遠超越之前的基因編輯脫靶檢測技術,這一技術首次證實:近年來興起的單堿基編輯技術有可能導致大量無法預測的脫靶

    單堿基基因編輯系統,基因治療又一利器

    TaC9-ABE單堿基編輯技術原理。黃博純 供圖近日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員賴良學與五邑大學副教授鄒慶劍團隊合作首次將腺苷脫氨酶與轉錄激活因子樣效應子(TALE)融合,開發了一種不會產生Cas9依賴性脫靶的新型堿基編輯系統TaC9-ABE。相關研究3月24日在線發表于《細胞發現》(

    作物基因組單堿基編輯方法研究取得進展

      單核苷酸點突變是作物許多重要農藝性狀發生變異的遺傳基礎。單堿基的變異會導致氨基酸替換或蛋白質翻譯終止,使基因功能發生改變,從而有可能產生優良的等位基因與優異性狀。傳統誘變及單堿基突變篩選技術(如TILLING)需要進行基因組規模的篩選,耗時、耗力且鑒定到的點突變數目和種類有限。基因組編輯技術,特

    新研究:精準基因編輯技術

      中國科學院遺傳與發育生物學研究所高彩霞研究組開創性地運用AI輔助結構預測,建立起基于三級結構的蛋白聚類方法,并擴展為全新的脫氨酶挖掘體系,開發了一系列具有中國自主知識產權的新型堿基編輯工具。該工作為蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研發的堿基編輯系統具有我國自主知識產權的精準基因編輯

    Science發布創新性CRISPR/Cas9技術

      利用一種脫氨酶將單核苷酸改變導入DNA中,研究人員創建了一種改進的CRISPR/Cas9工具,它能夠避免生成有害的雙鏈斷裂,減少采用CRISPR/Cas9技術可能引入的附加突變,且不需要添加DNA模板。這項發布在8月4日《科學》(Science)雜志上的新研究工作,是第二次報道這樣的精確基因編輯

    Nature-Biotechnology:北京大學魏文勝團隊開發新型編輯技術

      2019年7月15日,北京大學生命科學學院魏文勝課題組以長文形式于Nature Biotechnology在線發表了題為“Programmable RNA editing by recruiting endogenous ADAR using engineered RNAs”的研究論文,首次報道

    Nat-Med:在體內利用新型堿基編輯器有望治療遺傳疾病

      2018年10月9日/生物谷BIOON/---新生兒的父母可能都了解一種稱為苯丙酮尿癥(phenylketonuria)的代謝障礙。在瑞士,所有新生兒都會接受這種遺傳疾病的篩查。經發現患有苯丙酮尿癥的兒童需要吃特殊飲食,這樣苯丙氨酸就不會在體內堆積。過量的苯丙氨酸會遲滯精神和運動發育。如果這種遺

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