“條形碼”序列測序（BRBseq）廉價且高效
RNA測序是一種通過觀察基因表達來分析整個基因組的技術。如今，這種全基因組表達分析是基因組研究的標準工具，因為它們依賴于高通量技術，而這些技術本身已經變得廣泛可用。 盡管如此，RNA測序仍然是昂貴和費時的，因為它首先需要昂貴的準備一個完整的基因組庫——由細胞RNA生成的DNA池——同時數據本身也很難分析。所有這些都使得RNA測序難以運行，使得它被采用的程度沒有它能做到的那么廣泛。 在單細胞轉錄組學的革命推動下，一些新的方法提供了幫助，這種方法使用了所謂的“樣本條形碼”或“多路復用”。在這里，每個“條形碼”序列在庫準備過程中被添加到每個DNA片段中，以便在分析最終數據之前對每個片段進行識別和排序，這意味著這種方法只需要一個包含多個不同樣本或細胞的庫。 條形碼既降低了成本，又縮短了時間，這可以擴展到大樣本的批量RNA測序。但是，在適應和驗證大量RNA樣本的可靠和廉價分析方案方面仍然存在困難——這就是我們在分析細胞或組織的轉......閱讀全文
“條形碼”序列測序（BRBseq）廉價且高效
RNA測序是一種通過觀察基因表達來分析整個基因組的技術。如今，這種全基因組表達分析是基因組研究的標準工具，因為它們依賴于高通量技術，而這些技術本身已經變得廣泛可用。 盡管如此，RNA測序仍然是昂貴和費時的，因為它首先需要昂貴的準備一個完整的基因組庫——由細胞RNA生成的DNA池——同時數據本身
安捷倫：用于RNA測序的文庫制備與靶向序列捕獲解決方案
簡化的RNA和DNA測序解決方案，用于精簡臨床NGS 2020年9月1日，北京——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA試劑盒。該解決方案采用模塊化設計，為RNA 和 DNA樣品提供了一種簡單的平行分析方法，從而確保客戶能夠簡化并整合其工作流程，而無
《自然》：美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗
美首次對老鼠基因組的調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分――調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗室主任任兵教
通過序列雜交和條形碼進行單細胞原位分析
現代系統生物學有兩種革新技術：基因組學和單細胞生物學，前者具備同時監測生物體中所有基因和蛋白質的能力，后者則可以在自然微環境中跟蹤單細胞的一些特定基因。 兩種技術都很強大，但具有互補的局限性：基因組學平均了一個細胞群的異質性和空間復雜性，而單細胞技術一次只能探測幾個基因。因此，將基因組學與單細
RNA測序描繪人類視網膜的完整基因圖
來自馬薩諸薩州和哈佛醫學院的調查者們發表了人類視網膜的基因表達圖。Drs. Michael Farkas和他的研究員們報告了視網膜上基因表達的完整的目錄。 視網膜是眼睛后的神經組織。主要的功能是接受光的信號，并把光的信號轉化為神經信號并傳送給腦，從而形成我們的視覺。如果把眼睛比作照相機
美國FDA關于提交抗病毒藥物二代測序數據要求概述
2019年7月，美國食品藥品監督管理局（FDA）發布了關于抗病毒藥物產品提交二代測序數據的指南。指南為抗病毒藥物產品向FDA提交二代核苷酸序列分析程序以及支持耐藥性評估數據提供了意見。 一、背景信息 為保護公共衛生、避免出現可能傳染他人并導致不能通過已批準藥物產品控制疾病暴發的新型耐藥和交叉
雙RNA測序技術
在發表于《自然》（Nature）雜志上的一篇研究論文中， 由來自德國、奧地利和美國的研究人員組成的一個研究小組發現，采用一種允許在感染過程中同時研究細菌與宿主小RNA的新技術，可以揭示出兩者轉錄譜的改變。該研究小組描繪了他們的技術、該技術如何更多地幫助了解細菌感染機制，以及在研究中獲得的重要發現
專家指路：如何追上CRISPR技術快速發展的腳步？
每個月都有一大波新的CRISPR工具來襲。比如，Cas9抑制劑的出現可在各種場景下防止脫靶效應。人們也將CRISPR-Cas9系統與前沿的單細胞測序技術相結合，開發出新的策略。與此同時，研究人員開發出Cas9以外的效應物核酸酶，比如C2c2，靶向RNA以實現編輯和成像應用。 對于這些熱門的技術
靶向測序：表達譜分析的新選擇
沒有人愿意聽到“癌癥”這個詞。不過在提到前列腺癌時，人們的情緒往往更加復雜：有些人的腫瘤不會擴散，需要積極監控；而有些人就沒那么幸運，需要手術或放療和化療。醫生所面臨的挑戰是正確的診斷，再加上適當的治療。 Carlos S.Moreno是埃默里大學溫希普癌癥研究所（Winship Cancer
10x－Genomics獨創短讀序列技術－兩年收入增漲20倍
近日，基因檢測初創公司10x Genomics又籌集了3500萬美元。本次融資是該公司D輪融資的延續，10x Genomics將用這筆資金繼續推進研發工作和擴大產品營銷。 在2018年4月，10x Genomics就已籌集了5000萬美元的D輪融資，由Meritech Capital領投，Fi
首個亞洲人源基因檢測序列標準物質完成研制
6月，中國計量科學研究院和深圳華大基因研究院共同發布首個亞洲人源(炎黃一號)DNA序列標準物質(BW-5201)和大腸桿菌O157基因組DNA序列標準物質(BW-5202)。這是全球首次發布亞洲人源DNA和微生物基因組DNA序列標準物質，為基因檢測產業評估測序和數據分析的準確性提供了參考標準。
鐘聲教授團隊開發高通量蛋白互作檢測技術
通過深入了解基因組產物形成的相互作用網絡，人類基因組注釋功能得以飛速發展。隨著技術的進步，我們已經實現了DNA-DNA、蛋白質 -DNA、RNA-DNA和RNA-RNA相互作用的全基因組映射圖譜。但完成人類蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）的全基因組映射圖譜仍然是一項艱巨任務。 目前，大規模PP
Science發文：RNA測序有助于發現罕見基因變異
近日，來自紐約基因組中心、哥倫比亞大學等機構的研究團隊在Science發表了RNA測序應用的最新研究成果，文章題為“Genetic regulatory variation in populations informs transcriptome analysis in rare disease
RNA測序技術如何繪制全基因組轉錄終止？
近日，南方科技大學生命科學學院翟繼先團隊利用納米孔單分子RNA測序技術繪制了擬南芥全基因組水平轉錄終止圖譜。該方法能同時捕獲包括已轉錄過polyA位點的 readthrough轉錄本、完成3’末端切割的5’或3’切割產物、以及已完成或正在進行多腺苷酸化（polyadenylation）的轉錄本在
北京大學湯富酬等團隊發布單細胞測序技術最新研究成果
基于第三代測序（TGS）平臺的單細胞RNA-seq技術的進步加速了生物學研究。自2016年以來，已經開發了幾種基于TGS平臺的單細胞RNA-seq方法。由于受到低準確度和靈敏度的限制，它們要么結合基于NGS平臺的方法降低錯誤率，要么通過犧牲通量來提高檢測率。 2023年1月11日，北京大學湯富
新型腦成像技術給神經元貼上“條形碼”
美國冷泉港實驗室（CSHL）和瑞士巴賽爾大學的神經科學家團隊日前在《自然》雜志發表論文稱，他們開發出一種創新的腦成像技術，追蹤了小鼠大腦外部皮層數百個神經元連接。新技術能以前所未有的速度生成更詳細的圖片，比現有方法更快捷更有效，且成本直線下降，有利于未來認識神經發育障礙。 人類大腦中有1000
一波新的CRISPR工具浮出水面
當你讀到這篇文章時，又一波CRISPR工具將會浮出水面。它們將需要接受測試和優化。不過，如果你詢問開發者你在開展概念驗證研究時是否應當試用它們時，你將僅獲得鼓勵。畢竟，迄今為止它們還不能從Addgene公司獲得，但是將會很快上市了。 最新發布的一系列CRISPR工具包括新的譜系追蹤方法，該方法
基因編輯進展梳理－Part－II－基于CRISPRCas9的技術應用篇(下)
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展，但是解析復雜的基因型-表型關系仍
環狀－RNA－測序案例分析
案例：以結腸癌，卵巢癌，特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景：最新研究表明，circular RNAs 大量存在，是構成生物體 RNA 網絡的一部分，而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的
核糖核酸（RNA）測序
RNA在細胞中的穩定性較差，在實驗中也更容易受到核酸酶的攻擊。因為RNA是由DNA轉錄產生的，所以信息已經存在于細胞的DNA中。然而，有時也需要對RNA分子進行測序。雖然DNA測序給出了生物體的遺傳圖譜，但RNA測序卻反映了細胞中活躍表達的序列。為了給RNA測序，通常的方法是首先對從樣品中提取的
RNA甲基化測序
1、NSUN2影響m5C在HEK293細胞中整體分布情況NSUN2被報道是RNA甲基轉移酶，能使tRNAs和mRNA發生m5C甲基化修飾。為了探究NSUN2對HEK293細胞mRNA m5C甲基化修飾的影響。作者利用CRISP/Cas9技術敲減NSUN2（NSUN2-/-HEK293細胞）后進行
最準確的基因表達檢測方法——RNA測序遭遇“信任”危機？
當前，RNA測序成為了一種常用工具。 利用RNA測序，研究人員能夠定量地檢測各種生物體的基因表達，從而更好地了解細胞中正在發生的事情以及特定基因的功能。 RNA測序的準確性 早在2014年，《Nature Biotechnology》上發表了三篇文章。它們屬于RNA測序質量控制（SEQC）
Nature子刊：RNA測序鑒定小膠質細胞獨特表達基因
馬薩諸塞州綜合醫院(MGH)的研究者采用一種新的測序方法，鑒定了一組被腦免疫細胞——稱為小膠質細胞—— 用來感知需要其做出反應的致病組織、毒素或損傷細胞的基因。這些基因的鑒定，能使我們更好地理解小膠質細胞在正常大腦和神經退行性疾病中的作用，為保護諸如阿爾茨海默氏病和帕金森氏綜合癥引起的損傷帶
適合每個實驗室的新一代測序系統SOLiD－5500
【摘要】基于三十年的測序經驗，并由經過驗證的連接型測序的準確性所支持，全新的5500 SOLiD? 系統為每個實驗室提供了一個強大、實惠的新一代測序平臺。5500 SOLiD? 系統為分析一個或多個樣品提供了一種非常準確且經濟有效的解決方案，讓您靈活選擇優化周轉時間或通量。 也許您正在尋找一項新一
新型單細胞測序方法可有效追蹤癌癥免疫細胞
澳大利亞加文醫學研究所的科學家開發了一種新的單細胞測序方法RAGE-Seq（Repertoire and Gene Expression by Sequencing），該方法兼備高通量、靶向、長讀長和單細胞測序特征，能夠高準確度和靈敏度的識別全長抗原受體序列，追蹤與癌癥免疫反應相關的免疫細胞。7
安捷倫靶向序列富集系統支持樣本條形碼標記及索引
進一步提升測序效率，降低測序成本高達16倍 2010年2月24日，安捷倫科技公司(紐約證交所：A)在基因組生物學技術進展年會 (AGBT)宣布：安捷倫SureSelect 靶向序列富集系統，可以根據用戶所選擇的不同新一代測序平臺，實現每泳道12-16個樣本的并行DNA測序，從而降低測序成本
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，啟動子
下面以人的IL6（白細胞介素6）為例講述一下具體的操作步驟 一、打開Map viewer頁面，網址為 在search的下拉菜單里選擇物種，for后面填寫你的目的基因。 ? 二、點擊“GO”： 三、在步驟二圖示的右下角有一個Quick Filter,下面是讓你選擇的幾個復選框，在Gene前面的小方框
NCBI使用方法之一：Map－viewer查找基因序列，RNA，啟動子
下面以人的IL6（白細胞介素6）為例講述一下具體的操作步驟一、打開Map viewer頁面，網址為在search的下拉菜單里選擇物種，for后面填寫你的目的基因。二、點擊“GO”：三、在步驟二圖示的右下角有一個Quick Filter,下面是讓你選擇的幾個復選框，在Gene前面的小方框里打勾，然后點
原位進樣原理
原位測序技術的原理和應用點擊次數：664 發布日期：2022-3-23 來源：蘇州阿爾法生物實驗器材有限公司原位測序 (ISS) 是一種新方法，通過該方法直接在固定組織或細胞樣品的切片中對 mRNA 進行測序。原位測序原理關鍵是測序信息與其位置之間的聯系—在一些情況下，是亞細胞位置。這與傳統測序不