基因組分析揭示等位基因特異RNA編輯現象
核糖核酸(RNA)編輯是RNA水平一種常見的修飾,是增加基因轉錄和功能多樣性的重要形式。17日,來自中科院昆明動物研究所的消息,由張亞平院士領導的、多個研究機構加盟的團隊,在等位基因特異的RNA編輯研究上取得了重要進展。 中科院昆明動物研究所周中銀博士介紹,對二倍體生物來說,雖然兩個等位基因的表達調控對發育至關重要并與一些疾病相關,但現有的研究表明,諸多基因表現為單等位基因高表達。其中,等位基因特異的甲基化是產生等位基因特異表達產生的重要原因之一,但現有的研究主要集中于DNA層面。由于RNA在轉錄和翻譯過程中發揮了承前啟后的作用,各種各樣的RNA修飾相繼被發現報道,但是生物體內在RNA層面的修飾是否表現為等位基因特異的修飾,還沒有相關研究。 由張亞平院士領導的團隊研究了人類和小鼠各種組織中等位基因特異的RNA編輯情況。他們在人體中鑒定出315個等位基因特異的RNA編輯位點,且這些位點在不同組織中有相當比例的重疊。同......閱讀全文
中科院Science公布最新基因組
繼2012年中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成了首個山羊全基因組圖譜之后,6月昆明動物研究所,華大基因等處的研究人員又公布了綿羊基因組序列,并且將這一基因組與其它哺乳動物基因組進行了比對,構建了相關的系統發育樹。這一研究成果公布在6月6日Science雜志上。 參與這項
中科院基因組測序平臺聯盟成立
2月12日上午,在中國科學院條件保障與財務局的支持和推動下,中科院基因組測序平臺聯盟成立大會暨簽約儀式在中科院北京基因組研究所召開。條財局副局長曹凝及中科院廣州、武漢、上海、昆明及北京各區域中心專家代表和部分研究所代表共計20余人出席會議。 會上,北京基因組所副所長、黨委
中科院海洋所破譯海參基因組
記者從中科院海洋所獲悉,國際學術期刊PLoS Biology13日在線刊發了由中國科學院海洋研究所楊紅生研究員課題組和相建海、李富花研究員課題組主導,天津生物芯片技術公司、加拿大紐芬蘭紀念大學等單位合作,由張曉軍、孫麗娜、袁劍波等青年科研人員為共同第一作者,協力完成的研究論文“The sea c
中科院等完成橡膠草基因組序列解析
中國科學院遺傳與發育生物學研究所李家洋研究組與中國農業科學院、中國熱帶農業科學院等合作,在橡膠草基因組序列解析方面取得重要進展,標志著以橡膠草作為模式植物進行天然橡膠合成研究進入后基因組時代。研究成果近日在線發表在權威學術期刊《國家科學評論》(National Science Review)雜
中科院天津工生所構建高效基因組編輯方法
近日,中科院天津工業生物技術所研究員張學禮帶領的微生物代謝工程研究團隊和研究員畢昌昊帶領的代謝工程與合成生物技術研究團隊,在大腸桿菌中首次利用CRISPR/Cas9技術實現了四基因的同時高效編輯,兩個基因、三個基因、四個基因同時編輯效率分別達到100%、90%、40%。相關成果發表于《生物技術期
中科院免去楊煥明北京基因組所所長職務
日前,中國科學院經研究,決定:楊衛平同志任北京基因組研究所常務副所長(法定代表人,任期至本屆班子屆滿);免去楊煥明同志北京基因組研究所所長職務。在其官方網頁上顯示,于軍仍為北京基因組研究所副所長。 姓 名 楊衛平 性 別 男 出生日期
中科院利用CRISPR及TALEN技術獲基因組編輯新突破
來自中科院遺傳與發育生物學研究所、中科院微生物研究所的研究人員利用TALEN和CRISPR-Cas9技術,在六倍體面包小麥中成功實現了同時編輯3個同源等位基因(homoeoallele) ,并由此賦予了小麥對白粉菌(powdery mildew)的遺傳性抵抗力。這一突破性的成果發表在7月20日的
中科院海洋所破譯首個深海甲殼動物基因組
近日,中科院海洋所李富花研究員課題組和李新正研究員課題組合作破譯了國際上首個深海甲殼動物——深海水虱(Bathynomus jamesi)的基因組,并揭示了深海水虱體型巨大化和深海寡營養環境適應的獨特分子遺傳機制。 據悉,此研究是繼深海軟體動物和深海管蟲等深海物種之后,首次報道深海甲殼動物基因
中科院遺傳發育所在黍子的基因組研究中取得進展
多倍化在植物進化過程中反復發生,呈現出多倍體化-二倍體化的循環模式,所有被子植物至少經歷了一次多倍化事件。多倍體形成之后,通常會迅速進入二倍體化的過程,最終演變成二倍體。多倍化后的基因組休克和二倍化可能導致亞基因組優勢,即顯性基因組保留更多的祖先基因并顯示更高的同源基因表達。然而,二倍體化的分子
牡蠣基因組測序項目在中科院海洋所正式啟動
牡蠣基因組測序項目(OGP)日前在中科院海洋所正式啟動。 中國科學院海洋研究所介紹,開展牡蠣全基因組測序和組學研究,揭示牡蠣各種特異性狀的基因組學基礎,可以提升貝類和海洋基因組學研究水平,促進發展貝類養殖產業健康和可持續發展。 中國是牡蠣的故鄉,分布有近20種牡蠣。牡蠣是一種重要的海洋生物資源,
誰在先?“雞基因組”和“雞蛋基因組”
是先有雞還是先有雞蛋?這個問題相當惱人,恐怕很難說清楚。現在,研究人員回答了與這個問題一樣惱人的問題:是人類基因組中的成千上萬的長重復DNA片段中,那個是第一個產生的?那些被復制了? 這個答案發表在10月7日的《自然·遺傳學》雜志上。該研究給出了人類基因組中DNA重復片段復制的第一個進化證據,這種
葉綠體基因組
葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能的重要細胞器,葉綠體中進行的光合作用是嚴格地受到遺傳控制的。早在20世紀初,人們就已知葉綠體的某些性狀是呈非孟德爾式遺傳的,但直到60年代才發現了葉綠體DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。葉綠體基因組是一個裸露的環狀雙鏈DNA分子,其大小在1
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
中科院任命吳仲義為北京基因組研究所所長
2008年6月20日,中國科學院北京基因組研究所所長聘任、任命儀式在基因組所2樓報告廳舉行。會議由中科院北京分院黨組副書記劉松林主持,中科院副秘書長何巖,人事教育局局長李和風,基因組所黨委書記楊衛平,副所長于軍,所長助理胡松年研究員、王彩平研究員以及所黨委、紀委委員,中層管理干部,副研以上科研人員等
中科院“細菌全基因組測序及分析”取得階段性成果
中科院北京基因組研究所的胡松年研究員和浙江大學醫學院附屬二院的胡訊教授合作研究的項目“細菌Phenylobacterium zucineum全基因組測序及分析”取得階段性成果,相關論文發表在今年第9期的BMC Genomics上。 P.zucineum是合作方從K562細胞系中分離到的兼性細菌。系
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組
多倫多大學的科學家們發現,作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白(C2H2-ZF)實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究,有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員,是規模最大的一種人類蛋白。然而,人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-
中國新生兒基因組、胚胎基因組計劃啟動
為從根本上實現新生兒遺傳病的早發現、早診斷、早干預,7日,中國遺傳學會遺傳咨詢分會聯合復旦大學附屬兒科醫院在上海發起中國新生兒基因組計劃。 中國新生兒基因組計劃將在未來的5年內開展10萬例樣本的新生兒基因檢測,旨在構建中國新生兒基因組數據庫,建立新生兒遺傳病基因檢測標準,促進新生兒遺傳病基因檢
《基因組研究》:首張貓基因組草圖繪就
貓是研究人類失明和艾滋病模型之一,因此測序結果大有用處 一只名為“肉桂”(Cinnamon)的4歲雌性阿比西尼亞貓有幸成為第一只完成基因組測序草圖的貓。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在內的基因組“俱樂部”。相關論文11月1日在線發表于《基因組研究》(Genome Research)雜
中科院開發基于內源CRISPR系統植物病原菌基因組編輯方法
高效便捷的基因組操縱技術可推動病原菌致病機理的研究。水稻是世界上主要的糧食作物,由水稻白葉枯菌(Xanthomonas oryzae?pv.?oryzae,Xoo)引起的水稻白葉枯病是威脅水稻生產的主要病害之一。近日,中國科學院微生物研究所邱金龍團隊利用水稻白葉枯菌內源CRISPR-Cas系統,建立
中科院遺傳發育所水稻基因組編輯研究取得重要新進展
水稻突變體是進行水稻功能基因組學基礎研究和水稻分子設計育種的重要材料。常規的水稻突變體來源于自發突變或化學、物理及生物的誘變,具有很大的隨機性和局限性,不能滿足大規模的水稻功能基因組學研究和水稻分子設計育種的需求。利用高效便捷的CRISPR/Cas9基因組編輯技術和高通量的寡核苷酸芯片合成技術可
中科院微生物所在細菌耐藥基因組學研究獲進展
中科院微生物所朱寶利課題組在細菌耐藥基因組學研究中的最新進展,研究首次以基因組學大數據為依托,深入解析了耐藥基因在細菌間的傳播網絡和規律,對深入認識細菌耐藥性的進化、細菌耐藥的形成機制等具有重要意義。成果近日在線發表于《應用與環境微生物學》,并將于第82卷22期以“封面故事”形式發表。副研究員
中科院深圳先進院開發出人工基因組高效簡化策略
最小真核基因組的構建是基因組學中的重要議題,被稱為該領域的“圣杯”。通過基因組的精簡,去除冗余基因,可為認識生命的起源和進化提供重要線索,有助于深化對基因組功能組成和運轉方式的認識。2016年,最小原核基因組已由J. Craig Venter團隊構建出來。面對更為復雜的真核生物基因組,如何構建其最小
中科院植物所等揭秘構樹基因組組成及根系菌群
大約3100萬年前,構樹與桑樹分開,進化出了獨特的纖維內皮。構樹低木質素、高纖維素的獨特比例,使其營養豐富,易被牲畜消化吸收,這也可能是它可以與土壤微生物共生的原因。中國植物學家首次破譯了構樹的基因組,通過對基因組的解析發現了這種聯系,并于2月27日在《分子植物》上發表了該成果。構樹用于造紙、飼
基因組文庫法
基因組文庫法一)基因組DNA分離、純化和加工[Mbo I酶檢測]1.準備1.5ml小試管4個;每管內含有:基因組DNA(在TE或水中)?????????????10.0μg10×Mbo I緩沖液?????????????????????????2.5μlH2O????????????????????
基因組構的定義
中文名稱基因組構英文名稱gene organization定 ?義(1)單個基因的組成結構。一般包含啟動子、增強子、非翻譯序列、編碼序列等。真核生物和原核生物的一個顯著區別是前者具有內含子。(2)廣義指一個完整的生物個體內基因的組織排列方式。原核和真核生物的一個顯著區別是原核生物的結構基因成串分布,
基因組的分類
病毒基因組病毒基因組可以由RNA或DNA組成。 RNA病毒的基因組包含單鏈或雙鏈RNA,也包含一種或多種單獨的RNA分子。 DNA病毒基因組可以是單鏈或雙鏈DNA。大多數DNA病毒基因組由單個線性DNA分子組成,但有些由DNA病毒基因組由環狀DNA分子組成? 。原核基因組原核生物和真核生物基因組由D
煙草基因組計劃
生物技術和生命科學將成為21世紀引發新科技革命的重要推動力量。實施基因組計劃可以獲得一批具有自主知識產權的煙草重要性狀功能基因,全面揭示種質資源的遺傳背景,確立我國在煙草基因組研究上的核心優勢,對提升煙草育種工作整體水平、實現煙草品種的根本性突破、培育煙草新興產業、更好地發揮煙草模式作物的基礎研究作
基因組構的定義
中文名稱基因組構英文名稱gene organization定 義(1)單個基因的組成結構。一般包含啟動子、增強子、非翻譯序列、編碼序列等。真核生物和原核生物的一個顯著區別是前者具有內含子。(2)廣義指一個完整的生物個體內基因的組織排列方式。原核和真核生物的一個顯著區別是原核生物的結構基因成串分布,
基因組的定義
在分子生物學和遺傳學領域,基因組是指生物體所有遺傳物質的總和。這些遺傳物質包括DNA或RNA(病毒RNA)。基因組包括編碼DNA和非編碼DNA、線粒體DNA和葉綠體DNA。研究基因組的科學稱為基因組學。