上海生科院揭示反式剪接的發生機制
4月1日,Genes & Development 發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所徐永鎮研究組題為A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila 的研究論文。 RNA剪接通常發生在一個前體RNA (pre-RNA) 的分子內部,即“順式剪接”(cis-splicing),但也可以發生在兩個前體RNA分子之間,最終生成雜合的mRNA,稱為“反式剪接”(trans-splicing)。發生反式剪接的兩個前體RNA分子可以來自同一基因的同義鏈或正反義鏈,甚至來自于不同染色體上的兩個基因。已知的反式剪接基因數量相對較少,但普遍存在于真核生物中。低等真核生物,如錐蟲與線蟲,其絕大多數基因都需要進行反式剪接的加工,上世紀90年代的研究證明它們是由SL(Spliced Leader) RN......閱讀全文
上海生科院通過生物大數據揭示反式剪接的基因演化功能
11月2日,Nature Communications 發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組題為The evolutionary landscape of intergenic trans-splicing events in insects 的研究論文。該工作揭示了反
上海巴斯德所等基于轉錄組測序數據的反式剪接研究獲進展
11月2日,國際學術雜志Nature Communications 發表了中國科學院上海巴斯德研究所研究員郝沛與中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所的合作研究成果:The evolutionary landscape of intergenictrans-splicing events
研究揭示抗生素抗性基因可經反式剪接參與蛋白產生
7月9日,國際知名學術期刊Cell Research在線發表了中科院上海生科院生物化學與細胞生物學研究所李伯良研究組題為Production of ACAT1 56-kDa isoform in human cells via trans-splicing involving the amp
上海生科院揭示反式剪接的發生機制
4月1日,Genes & Development 發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所徐永鎮研究組題為A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila 的研究論
CreloxP重組系統技術詳解
Cre-loxP重組系統一.Cre-loxP重組系統作用原理1. Cre重組酶和loxP位點Cre重組酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大腸桿菌噬菌體P1的Cre基因編碼,是由343個氨基酸組成的38kD的蛋白質。它不僅具有催化活性,而且與限制酶相似,能夠特異性
重組系統腺相關病毒產品說明
一.Cre-loxP重組系統作用原理Cre重組酶和loxP位點Cre重組酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大腸桿菌噬菌體P1的Cre基因編碼,是由343個氨基酸組成的38kD的蛋白質。它不僅具有催化活性,而且與限制酶相似,能夠特異性識別loxP位點。LoxP(l
關于內含肽的種類介紹
從內含肽的內部有無自導引歸巢核酸內切酶結構域,可將內含肽分為2種類型。一種是全功能型內含肽(maxi—intein),具有蛋白剪接活性和自導引核酸內切酶序列(homingendonuclease);另一種是微型內含肽(mini—intein),只有蛋白剪接活性。其中自導引歸巢核酸內切酶結構域的缺
內含肽的種類
從內含肽的內部有無自導引歸巢核酸內切酶結構域,可將內含肽分為2種類型。一種是全功能型內含肽(maxi—intein),具有蛋白剪接活性和自導引核酸內切酶序列(homingendonuclease);另一種是微型內含肽(mini—intein),只有蛋白剪接活性。其中自導引歸巢核酸內切酶結構域的缺失在
知識分享:維真-CreloxP-重組系統腺相關病毒產品說明
一.Cre-loxP重組系統作用原理 Cre重組酶和loxP位點 Cre重組酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大腸桿菌噬菌體P1的Cre基因編碼,是由343個氨基酸組成的38kD的蛋白質。它不僅具有催化活性,而且與限制酶相似,能夠特異性識別loxP位點。
外顯子重復的定義
中文名稱外顯子重復英文名稱exon duplication定 ?義(1)一個基因內部產生一個或者多個外顯子的復制拷貝。(2)兩分子同種前體RNA進行反式剪接時,成熟RNA分子上出現重復的外顯子序列。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)
CreloxP重組系統技術詳解
Cre-loxP重組系統 一.Cre-loxP重組系統作用原理 1. Cre重組酶和loxP位點 Cre重組酶(Cyclization Recombination Enzyme)由大腸桿菌噬菌體P1的Cre基因編碼,是由343個氨基酸組成的38kD的蛋白質。它不僅具有催化活性,
楊雪瑞課題組發現廣泛存在的異鏈嵌合RNA:cscRNA
轉錄組的復雜性是高等生物的標志性特征,是蛋白質組多樣性的主要來源,同時也極大擴充了非編碼RNA的種類與功能。除經典的RNA可變剪接之外,不同基因間的分子融合產生嵌合RNA(chimeric RNA),也是轉錄組復雜性的重要來源。DNA水平的基因重組與RNA水平的非經典剪接事件,包括順、反式剪接(
Cell-Systems:構建RNA結合蛋白的剪接調控作用預測模型
基因組研究結果顯示,人體內超過90%的基因存在選擇性剪接(alternative splicing)。該過程在不同組織以及不同生理階段受到嚴格的調控,其失調會導致多種疾病的發生。選擇性剪接的體內調控主要由前體mRNA中的順式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子(trans-a
關于外顯子的表達序列介紹
在反式剪接中,不同mRNA的外顯子可以被接合在一起。外顯子在剪接(Splicing)后仍會被保存下來,并可在蛋白質生物合成過程中被表達為蛋白質。外顯子是最后出現在成熟RNA中的基因序列,又稱表達序列。既存在于最初的轉錄產物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。術語外顯子也指編碼相應RNA外
18億美元合作-羅氏與Ascidian共同開發RNA外顯子編輯療法
6月18日,Ascidian Therapeutics宣布與羅氏(Roche)達成一項總額高達約18億美元的研究合作與許可協議,將共同發現和開發針對神經系統疾病的RNA外顯子編輯療法。 根據協議,Ascidian將向羅氏提供公司針對特定未公開神經科學靶點的RNA外顯子編輯技術獨家權益。作為合作
PNAS:-融合基因組學揭示橫紋肌肉瘤細胞起源
基因融合一直被認為是腫瘤獨有的特征。基因融合是指染色體上兩個異位的基因嵌合在一起,由于染色體發生易位、缺失或者倒置造成的,通常在癌癥的發生發展扮演著重要的角色,并且可以作為診斷和治療癌癥的靶標。基因融合現象最早在慢性粒細胞白血病中發現 BCR-ABL基因融合(費城染色體)。除血液系統腫瘤外,在實
轉基因——基因標靶
Gene Targeting Outline?(University of Michigan Transgenic Animal Model Core)This is a brief outline of the steps necessary to produce mice with a muta
基因和基因檢測
基因一詞來自希臘語lγ?νο? (génos),意為“種族、后代”,是指攜帶有遺傳信息的一段DNA(脫氧核糖核酸)或RNA(核糖核酸)序列。基因是控制性狀的基本遺傳單位:比如人的身高、體重、皮膚顏色甚至壽命都部分或全部由基因控制。我們每個人都和他人不同(即所謂的個體差異),也是由基因序列上的差異控制
Adv-Sci|中山大學陳旭/林天歆/白守民合作揭示增強前列腺癌的放射抗性
放射療法是治療前列腺癌(PCa)的武器庫,但放射抗性嚴重損害了其有效性。失調的RNA剪接因子廣泛參與腫瘤進展。盡管如此,剪接因子在PCa中對放射抗性的作用仍未得到充分探索。2024年9月17日,中山大學陳旭、林天歆、白守民共同通訊在Advanced Science在線發表題為“PTBP1 Reg
轉錄組測序揭示乳腺癌重排
即將在本周《美國科學院院刊》(PNAS)的網絡版上發表的一篇論文中,一個國際研究小組介紹了一項利用高通量的轉錄組測序來發現乳腺癌細胞系中的基因組重排的原理論證研究。美國克萊格凡特研究院(J.Craig Venter Institute)、Lugwig癌癥研究所的三個分所、以及紐約斯隆-凱特琳癌癥
David-Liu首次通過AAV病毒載體在動物體內進行堿基編輯作用
堿基編輯器用于研究和治療遺傳性疾病的成功取決于將其體內傳遞給相關細胞類型的能力。通過腺相關病毒(AAV)的傳送受AAV打包能力的限制(AAV的基因組包裝大小限制為≤5kb),因此無法使用全長堿基編輯器。 2020年1月14日,博德研究所David Liu團隊在Nature Biomedical
死亡基因的基因類型
這一研究成果發表在美國神經學年鑒上,科學家在研究阿爾茲海默癥等病時,意外發現這一基因,該基因有AA型、GG型、AG型三種類型。一個人有36%的可能性是AA型,有16%的幾率是GG型,有48%的幾率是AG型。
基因靶向的基因敲除
實驗步驟構建重組基因載體絕大多數的基因敲除策略都是基于同源重組的機制,其基因載體包括載體骨架、靶基因同源序列和突變序列及選擇性標記基因等非同源序列,其中同源序列是影響同源重組效率的關鍵因素。用電穿孔顯微注射方法把重組DNA轉入受體細胞(一般是胚胎干細胞)核內。同源重組基因重組時以載體的同源序列取代染
基因及基因產物分析
? 基因突變引起的單基因病往往表現在酶和蛋白質的質和量的改變或缺如。因此,酶和蛋白質的定性定量分析是診斷單基因病或分子代謝病的主要方法。根據分子代謝病的臨床特點可以從三個層次檢測和分析。 1.代謝產物的檢測酶缺陷導致一系列生化代謝紊亂,從而使代謝中間產物、底物、終產物旁路代謝產物發生變化。因此,檢
ras基因的基因結構
ras基因在進化中相當保守,廣泛存在于各種真核生物如哺乳類,果蠅,真菌,線蟲及酵母中,提示它有重要的生理功能.哺乳動物的ras基因家族有三個成員,分別是H-ras,K-ras,N-ras,其中K-ras的第四個外顯子有A,B兩種變異體.各種ras基因具有相似的結構,均由四個外顯子組成,分布于全長約3
與基因沉默相關特殊基因
奧地利格雷戈爾·門德爾植物分子生物學研究所日前宣布,一個包括該研究所、中國同濟大學、美國加利福尼亞大學等機構科學家在內的國際科研小組發現了一種特殊基因,沒有它,植物細胞內其他一些基因就只能保持沉默。最新一期英國《自然》雜志網絡版發表了這個國際科研小組的論文。這一科研小組發現的特殊基因名為RDM1,它
簡述ras基因的基因結構
ras基因在進化中相當保守,廣泛存在于各種真核生物如哺乳類,果蠅,真菌,線蟲及酵母中,提示它有重要的生理功能.哺乳動物的ras基因家族有三個成員,分別是H-ras,K-ras,N-ras,其中K-ras的第四個外顯子有A,B兩種變異體.各種ras基因具有相似的結構,均由四個外顯子組成,分布于全長
基因重組的應用——基因診斷
通過使用基因芯片分析人類基因組,可找出致病的遺傳基因。癌癥、糖尿病等,都是遺傳基因缺陷引起的疾病。醫學和生物學研究人員將能在數秒鐘內鑒定出Z終會導致癌癥等的突變基因。借助一小滴測試液,醫生們能預測藥物對病人的功效,可診斷出藥物在ZL過程中的不良反應,還能當場鑒別出病人受到了何種細菌、病毒或其他微生物
基因重組應用——轉基因技術
基因重組中轉基因技術的理論基礎來源于進化論衍生來的分子生物學。基因片段的來源可以是提取特定生物體基因組中所需要的目的基因,也可以是人工合成指定序列的DNA片段。基因重組DNA片段被轉入特定生物中,與其本身的基因組進行重組,再從重組體中進行數代的人工選育,從而獲得具有穩定表現特定的遺傳性狀的個體。該技
假基因的代表基因介紹
Hirotsune博士指出:“這些發現將有助于未來人類疾病的治療。當老鼠的假基因功能被阻斷,疾病就產生了,因此,理論上來說,假基因的功能異常也可能是導致人類疾病產生的因子。”其實這項發現是隨機發生的,因為當時研究人員是為了另一項完全不同的實驗制作轉殖鼠,他們將DNA注入受精卵,使得DNA隨機嵌入老鼠