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  • 發布時間:2021-08-18 15:58 原文鏈接: wb蛋白在重復實驗時還需要煮嗎

    蛋白樣品的制備是蛋白質組研究的第一步,無論后續采用怎樣的分離或鑒定手段,樣品制備都是關鍵步驟。因此,為了完全分析所有的細胞內蛋白,組織與細胞必須進行有效的破碎。本文在此介紹幾種較為常見的方法。

    變性條件——SDS LB直接裂解:
    用常溫或者高溫預熱過(預熱更有利于阻止蛋白水解或者磷酸酶去磷酸化,但容易遺忘,而LB久煮會改變某些性質)的1*SDS LB(或者略高1.5*)直接加到細胞或者組織上并煮樣。

    通常6孔板細胞80%以上密度,需200ul,其他按平板面積比類推。通常條件下,SDS LB都是過量的(因此不一定要嚴格參考SDS LB稀釋比);如果SDS LB不夠,樣品核酸、蛋白濃度過高時,煮樣后會發現tip吸不上來,非常粘、一砣一砣的,很容易堵住tip。

    這時候常規做法有兩種:

    1.再煮5min。常規煮樣時間3-5min,樣品過濃時就煮10min;

    2.如果10min煮樣后,仍然吸不起來,才適當增加SDS LB,繼續煮; 也可以對樣品進行超聲。煮樣時間若過長,蛋白會凝固,此時以失去繼續WB的意義,請丟棄(判斷標準:出現明顯的蛋白沉淀和水分層)

    此方法的缺點是:SDS LB煮過的樣品如果用來做IP,需要特殊方法,因此,這種制備方法制備的樣品有使用局限。

    非變性裂解法:
    裂解細胞請盡量冰上操作,減緩酶解作用。

    裂解液配方是:20mM Tris/HCl, pH7.6, 100mM NaCl, 20mM KCl,1.5mM MgCl2, 0.5% NP-40 and protease inhibitors (20μg/ml leupeptin,10μg/ml pepstatin A and 10 μg/mlaprotinin)(此裂解液可用于抽提核蛋白),其中蛋白酶抑制劑可用0.5mMPMSF替代;如果還要做磷酸化蛋白,加1mM Na3VO4(現加現用),10 mM NaF, 1 mM Na3VO4, 50 mMbeta-GP。

    此方法的優點:NaCl濃度略低于生理狀態,保證裂解細胞的方式較為溫和,便于隨后的IP等試驗。其他Na鹽濃度的細胞裂解液也很常見,諸如0.15M(生理鹽濃度)、0.3M、0.6M(高鹽系列,裂解細胞時染色體會析出,細胞碎片和沉淀非常粘稠)及0.8-1.2M;0.3M及以下適合 IP試驗,0.6M及以上適合純化蛋白,尤其相互作用較強的復合體,要得到純化的一些復合體的組成蛋白一般采用極端的高鹽裂解細胞。

    組織塊裂解:
    組織塊較大用勻漿的方法最合適,現在有不少轉頭很小的勻漿器。

    當組織超微量的時候,比如50mg新鮮癌組織,建議采用的方法是

    1. 低溫(剪)攪碎,成肉糜狀。

    2. 錫箔紙包裹好,放入少量液氮,快速敲擊(控制力量,盡量避免弄破錫箔紙),進一步破碎;反復多次。

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