PNAS：RNA剪接調控研究方面新的進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制，并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。 RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁，也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中，mRNA前體被剪接成為成熟的mRNA一般需要在多種蛋白質及snRNA的幫助下，經歷兩步轉酯剪接反應來完成。目前對于第二步剪接反應的調控知之甚少。 馮英研究組在前期工作中發現了一種特殊的mRNA前體，該前體在剪接反應已經開啟的情況下，僅將轉酯反應進行到第一步即停止，第二步反應則被完全抑制。馮英研究員指導的博士生李璜等研究人員對造成這一特殊現象的機制進行了深入研究。利用多種體外、體內的剪接模型以及定點突變，研究組發現剪接位點附近形成的RNA二級結構會顯著抑制第二步剪接反應的發生;同時還發現單鏈DNA結合蛋白FUBP1通過與剪接沉默子(ESS)元件結......閱讀全文
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
來自中國科技大學，英國鄧迪大學的研究人員圍繞一種關鍵小蛋白：Stc 1的結構和功能展開了研究，從中揭示出了裂殖酵母中RNAi與染色質修飾之間的分子作用機制，指出了非編碼RNA的又一重要作用。相關成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上。 文章的通訊作者是中國科技大學生命科學學
PNAS：用RNA干擾來治療惡性腫瘤
套細胞淋巴瘤（MCL）被認為是最具侵襲性的血癌，中位生存時間僅為七年，目前可用的治療方法很少。每年有三千美國人被診斷為MCL，盡管用于身體其他部位轉移瘤的個性化療法已經取得了一定進展，但是，系統性的將治療藥物傳遞到癌細胞，對世界癌癥研究來說仍然是個挑戰。 最近，以色列特拉維夫大學（TAU）的一
異常剪接?
中文名異常剪接定????義指對序列庫中異常剪接mRNA的鑒定和分析隸屬領域生物領域主要功能處理多順反子性轉錄單元，調控轉錄效率和mRNA的穩定性，同時可以增加產物蛋白的多樣性
自剪接
自剪接(self-splicing)出現在稀少的內含子組成核酸酶，核酸酶在只有RNA的情況下代替了剪接體的功能。自剪接的內含子有兩種，稱為I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型內含子以與剪接體類似的方式進行剪接，但不需要任何蛋白質。這種相似性使人相信這些內含子與剪接體在演化過程上有著關連。自剪接亦可能是非常古老，且
科學家首次展示RNA剪接分子時鐘精確原子模型
? ?西湖大學生命科學學院施一公教授研究組題為《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接體激活過程中結構重塑的分子機理》的論文，11月27日在《科學》雜志以長文形式發表。此文報道了釀酒酵母處于激活狀態的剪接體2.5埃的高分辨率電鏡結構，該結構是目前報道的最高分辨率的剪接體結構，首次展
PNAS：利用RNA控制CRISPR/Cas9基因編輯
在過去的幾年里，研究人員找到了一種方法利用天然存在的細菌免疫系統CRISPR/Cas9來失活或糾正任何生物體內的特定基因。然而，CRISPR/Cas9持續地發揮基因編輯活性，帶來了額外編輯不必要位點的風險。 現在，來自加州大學圣地亞哥醫學院、Ludwig癌癥研究所和艾希司制藥公司（Isis P
上海生科院揭示新RNA剪接因子調控植物脫落酸信號途徑
9月25日，國際學術期刊Nature Communications 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為An Arabidopsis PWI and RRM motif-containing protein is critical for pre-mR
北京基因組所揭示RNA甲基化調控基因剪接機制
中國科學院北京基因組研究所精準基因組醫學重點實驗室及遺傳與發育協同創新中心楊運桂課題組在研究m6A甲基化修飾調節mRNA選擇性剪接規律過程中，發現了讀碼器YTHDC1通過招募前體mRNA剪接因子SRSF3同時抑制剪接因子SRSF10與RNA的結合，促進外顯子被保留的分子機制。該研究結果于2016
剪接位點
中文名稱剪接位點英文名稱splicing site;splice site定 義剪接體可識別的RNA前體中內含子和外顯子連接邊界的序列和接頭位點。根據位置不同可以分為供體和接納體剪接位點。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），基因表達與調控（二級學科）
剪接體
剪接體（英文：spliceosome）定義：由核小RNA(snRNA，U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白質因子(約100多種)動態組成、識別RNA前體的剪接位點并催化剪接反應的核糖核蛋白復合體。只與SMT蛋白理解與糖性一致。
PNAS驚人發現：沉默基因的RNA可直接遺傳
近年來人們發現，父母的生活經歷會對后代產生顯著的影響。營養不良、接觸毒素或罹患疾病會改變父母的基因表達模式，這種改變在某些情況下能傳遞給下一代。然而，這種非基因遺傳機制一直是一個謎。 十月十七日馬里蘭大學的研究人員在美國國家科學院院刊PNAS雜志上發表文章指出，非基因遺傳機制其實可能非常簡單。
研究人員揭示RNA剪接在阿爾茨海默癥中的作用
2019年10月8日，美國貝勒醫學院Joshua Shulman教授課題組在Cell Reports發表題為Tau-mediated Disruption of the Spliceosome Triggers Cryptic RNA-splicing and Neurodegeneration
上海生科院揭示RNA可變剪接在細胞周期時序性的調控機制
3月25日，國際學術期刊Elife 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所王澤峰研究組的最新論文“An extensive program of periodic alternative splicing linked to cell cycle progression”。該工作
研究人員開發環形RNA定量和剪接體轉換識別新方法
2020年1月3日，中國科學院北京生命科學研究院趙方慶團隊在《自然-通訊》（Nature Communications）雜志上發表題為Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw
中科院最新PNAS文章
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展：“Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing re
簡述第Ⅳ類內含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因組共有約400個tRNA基因,含有內含子的基因僅占十分之一。內含子的長度從14到46個堿基對不等,它們之間并無保守序列,切除內含子的酶識別僅是共同的二級結構,而不是共同的序列。通常內含子插入到靠近反密碼子處,與反密碼子堿基配對,未成熟tRNA的反密碼子環不存在,而是以插入的內含子所構成的
Nature子刊:深度學習預測傳統RNASeq無法檢測的選擇性剪接
項目負責人Yi Xing博士是CHOP計算和基因組醫學中心主任，本周他與博士生Zijun Zhang和Zhicheng Pan在《Nature Methods》報道了這款DARTS的框架。DARTS，又稱為深度學習加強的RNA-seq轉錄剪接分析（Deep-learning Augmented
精氨酸甲基化在RNA剪接和翻譯全局調控中的關鍵作用
7月15日，中國科學院上海營養與健康研究所研究員王澤峰課題組在Science Bulletin上發表了題為A systematic survey of PRMT interactomes reveals the key roles of arginine methylation in the g
選擇性剪接
中文名選擇性剪接外文名alternative splicing別????名可變剪接作????用mRNA前體加工特????點表達水平的不同而導致不同的表型定義選擇性剪接（也叫可變剪接）是指從一個mRNA前體中通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點組合）產生不同的mRNA剪接異構體的過程，使得最終的蛋白
Cell子刊：RNA剪接或成治療阿爾茲海默癥的潛在分子靶標
眾所周知，RNA剪接失調與某些神經退行性疾病的發展有關，例如脊髓性肌萎縮和肌萎縮性側索硬化癥。而阿爾茲海默癥作為世界上最常見的神經退行性疾病，在這一領域仍未得到詳細的研究。 于是，在2013年，美國Emory大學的Seyfried教授課題組在這一領域開啟了最前沿的研究。該研究首次發現RNA剪接
PNAS：U2AF的不同構象在mRNA前體剪接中起著關鍵性作用
2016年11月6日/生物谷BIOON/--在基因的RNA轉錄本能夠表達蛋白之前，它們的非編碼區被一種稱作剪接體的復合體移除。在一項新的研究中，德國科學家們報道這種分子復合體的一種成員的不同構象在這種移除過程中發揮著至關重要的作用。 RNA充當著將儲存在DNA中的遺傳信息有序地轉化為合成特異性
前剪接體和剪接體的分離及分析實驗
剪接體是由 RNA 和蛋白質構成的核糖核蛋白體（RNP)，它在前體 mRNA 的剪接過程中可去除前體 mRNA 的內含子。snRNP 是由 snRNA 及其結合蛋白組成，在前體 mRNA 的剪接過程起著重要作用。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編：鄭曉飛。實驗方法原理剪接體是由 RNA 和蛋白質
前剪接體和剪接體的分離及分析實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 剪接體是由 RNA 和蛋白質構成的核糖核蛋白體（RNP)，它在前體 mRNA 的剪接過程中可去除前體 mRNA 的內含子。snRNP 是由 snRNA 及其結合蛋白組成，在前體 mRNA 的剪接過程起著重要作用。
關于第Ⅲ類內含子的剪接hnRNA的剪接的介紹
核基因hnRNA內含子的剪接點序列為…外顯子…↓GU…內含子…AG↓…外顯子…,這就是普遍適用的所謂Breathnach-Chambon規則（GU-AG規則）(GU-AG rule),此規律不適合于線粒體和葉綠體的內含子,也不適合于tRNA和某些編碼rRNA的核結構基因,酵母的分支位點序列是高度
第1類內含子自我剪接rRNA的自我剪接介紹
第1類內含子,其5’剪接點和3’剪接點的序列絕大部分為…外顯子…U↓…內含子…G↓…外顯子…,除了剪接點序列特征之外,第1類內含子還具有比較保守的4種10一12核苷酸的序列,分別以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能與Q序列互補,R序列能與S序列互補,形成一個所謂中部
前剪接體和剪接體的分離及分析實驗
實驗方法原理 剪接體是由 RNA 和蛋白質構成的核糖核蛋白體（RNP)，它在前體 mRNA 的剪接過程中可去除前體 mRNA 的內含子。snRNP 是由 snRNA 及其結合蛋白組成，在前體 mRNA 的剪接過程起著重要作用。實驗材料 PIP 10 載體核苷酸焦磷酸酶RNasinT7 RNA 聚合酶
PNAS：芹菜素殺傷癌細胞
近日，一項新研究表明，地中海飲食中豐富的化合物可以剝奪癌細胞逃避死亡的 “超級動能”。這項由美國Ohio State大學的研究人員發現，一種化合物芹菜素能誘導乳腺癌細胞死亡。 但是，這些健康食品在體內工作的實際分子機制在許多情況下仍是一個謎。香菜，芹菜和甘菊茶是芹菜素最常見的來源，它被
PNAS:－融合基因組學揭示橫紋肌肉瘤細胞起源
基因融合一直被認為是腫瘤獨有的特征。基因融合是指染色體上兩個異位的基因嵌合在一起，由于染色體發生易位、缺失或者倒置造成的，通常在癌癥的發生發展扮演著重要的角色，并且可以作為診斷和治療癌癥的靶標。基因融合現象最早在慢性粒細胞白血病中發現 BCR-ABL基因融合（費城染色體）。除血液系統腫瘤外，在實
計算機技術還能幫助揭示癌癥惡化的分子機制！
近日，費城兒童醫院（CHOP）領導的一項研究揭示了蛋白質可變剪切與促癌基因之間的聯系。相關結果發表在《PNAS》雜志上。 文章作者，計算與基因組學中心主任Xing博士說：“我們的研究為癌癥驅動基因與選擇性剪接之間的關系提供了見解，這些發現可用于指導靶向可變剪接的癌癥療法的發展”。 選擇性剪接
關于基因剪接的簡介
基因組中或基因組間發生遺傳信息的重新組合，被稱為DNA重組（DNA recombination），其中發生在基因組中的DNA重組又稱DNA重排。包括同源重組、特異位點重組和轉座重組等類型，廣泛存在于各類生物。體外通過人工DNA重組可獲得重組體DNA，是基因工程中的關鍵步驟。