FDA斥資17000萬購Illumina測序儀檢測病原體
美國FDA采購Illumina公司1700萬美元MiSeq測序儀及試劑用于病原體檢測 2012年9月18日，來自美國圣地亞哥BUSINESS WIRE的消息 C Illumina公司（納斯達克代碼：ILMN）今天宣布，它贏得了一份來自美國食品藥品監督管理局（FDA）的合同，為該機構提供MiSeq測序系統及試劑，以便開展食品安全相關的沙門氏菌和產志賀毒素大腸桿菌的全基因組分析進行病菌爆發的溯源。這份五年期的合同價值1700萬美元。 FDA已有的幾臺MiSeq系統正在用于加強建設其現有資源和培訓方面的能力，進一步展現全基因組測序技術在病原檢測概念驗證方面的優勢。近期，FDA希望在食品安全相關的沙門氏菌上獲得數據，這對未來疫情的爆發的追蹤溯源將具有非常重要的意義。 FDA的國立及州立實驗室檢測、分離并處理各種各樣的腸道病原體。利用MiSeq，他們能從以往的病原體采集物以及全國各地農產品中采集而來的細菌中產生高質量的全......閱讀全文
我國科學家率先完成棗全基因組測序
日前，河北農業大學教授劉孟軍團隊與深圳華大基因科技服務有限公司合作，在世界上率先完成棗樹的高質量全基因組測序，使棗樹成為世界鼠李科植物和我國干果樹種中第一個完成基因組測序的物種。《自然—通訊》10月29日在線發表了該成果。 劉孟軍說，其團隊自2010年啟動棗基因組計劃，從棗基因組大小
謝曉亮：單細胞全基因組測序曙光初現
?謝曉亮 12月21日出版的美國《科學》雜志發表了題為《單細胞全基因組測序探索精子重組規律和遺傳缺陷》的論文。同時，該期《科學》雜志也將單細胞全基因測序列為2013年六大值得關注的科學領域之一。 該論文由美國科學院院士、哈佛大學教授謝曉亮課題組與北京大學生物動態光學成像中心（
全基因組測序可作為一線診斷工具
近日，一項涉及54個國家1000個家庭的研究表明，全基因組測序對未確診疾病的診斷率比經典遺傳診斷方法還高。科學家們呼吁將全基因組測序作為未確診疾病的一線診斷工具，以給患者帶來更好的醫療護理。相關結果以《Clinical exome sequencing: results from 2819 sa
首個中國地區古人全基因組數據被測序
近日，《當代生物學》發表了首次針對中國地區古人類的全基因組研究成果。該項目由中國科學院古脊椎動物與古人類研究所和德國馬普進化人類研究所等團隊合作完成，研究分析了距今4萬年前出土于北京房山田園洞的一具男性個體基因組，發現東亞早期人群組成十分復雜。 雖然歐洲和西伯利亞地區都有古人類樣本基因組被測序
基因是否表達，做個cfDNA全基因組測序就可揭曉
8月29日，《Nature Genetics》雜志上的研究表明，血循環游離DNA（cfDNA）可提供線索來預測基因的表達。 全基因組測序就能知道基因是否表達 基因表達(gene expression)是指細胞在生命過程中，把儲存在DNA順序中的遺傳信息經過轉錄和翻譯，最后轉變成具有生物活性的
《PLoS生物學》：老鼠全基因組測序圖公布
最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上，美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。 在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后，研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠
全基因組測序是癌癥診斷的強有力工具
? 一位沒有明顯癌癥家族史的婦女卻罹患了早發性乳腺癌和卵巢癌，以及與治療有關的急性髓細胞樣白血病。研究人員對這名婦女進行了全基因組測序，所用的是從該患者的皮膚和骨髓中獲取的DNA。在許多被懷疑患癌癥可能性增加了的病人中，常規性的候選基因測試（如BRCA1??和??BRCA2突變檢測）無法顯示出有用的
中國科學家PNAS發布辣椒全基因組測序
辣椒(Capsicum annuum)是一種重要的經濟作物，它在滿足人們口腹之欲的同時，還是世界上廣為使用的藥物。辣椒富含維生素和營養，可以用來生產許多藥物、天然染色劑和化妝品。 為了更好的理解辣椒屬的進化、馴化和特化，四川農業大學玉米研究所、遵義農科院辣椒研究所、華南農業大學園藝學院
Science新聞：英國公布大型全基因組測序計劃
基因分析技術在快速發展，昨日英國首相宣布了一項大型計劃，將對患有癌癥及罕見疾病的十萬英國人進行全基因組測序。現在許多國家都在為治療疾病而努力解碼國民的DNA，而英國這一新項目的不同之處在于，其測序的是全基因組而非基因組個別區域。 英國首相David Cameron在聲明中稱，英國國民醫
Genome－Res：全基因組測序追蹤耐藥細菌傳播機制
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）是一種常見的引發院內感染的致病菌，其也是資源不足醫院感染的一大負擔，此前當資源較好的臨床機構運用全基因組測序來追蹤MRSA的擴散時，針對有限的感染控制的傳播動力學常常并不清楚，近日，來自劍橋大學的研究人員就利用全基因組測序的技術揭示了高傳播率的資源受限醫院中M
世界首個梅花全基因組重測序研究完成
日前，北京林業大學張啟翔教授領銜的國家花卉工程技術研究中心，與青島華大基因研究院、深圳華大生命科學研究院以及賓夕法尼亞州立大學等單位通力合作完成了首個梅花全基因組重測序研究，構建完成了世界首張梅花全基因組變異圖譜，“梅花花部性狀的遺傳結構”（The genetic architecture of
Illumina推出Nextera－DNA－Flex全基因組測序制備產品
近日，Illumina宣布推出一款全新的全基因組測序(WGS)文庫制備產品——Nextera DNA Flex，它讓全血和唾液樣本省去了樣本制備，也讓文庫制備流程跳過了一些繁瑣步驟，比如DNA的機械片段化、定量和歸一化。Nextera DNA Flex提供了一個快速、整合的流程，適合廣泛的應用，
近期全基因組測序研究進展一覽
【1】Cell：全基因組測序揭示出自閉癥新的基因變異doi：10.1016/j.cell.2017.08.047自閉癥有遺傳的根源，但是大多數病例并不能夠通過當前的遺傳測試加以解釋。如今，在自閉癥兒童中發現的基因組模式---細胞內完整的一套遺傳指令---揭示這種出這種疾病的一種新的遺傳特征。這種特征
全基因組測序解決虎亞種紛爭：6亞種體系
研究人員運用群體基因組學方法描繪了迄今為止最完整的虎演化史，解析了其自然選擇和生態適應性的遺傳基礎，確認了現存虎應劃分為孟加拉虎、馬來虎等6亞種，由此解決了數十年以來關于虎亞種劃分的爭議，奠定了世界虎保護單元策略制定的科學基礎。 虎的物種形成時間大約在2-3百萬年前，群體基因組學分析將現代虎的
JAMA：全基因組測序用于臨床仍存在技術挑
據3月12日發表在《美國醫學會雜志》上的一則研究報告披露，在一項有12名成年人參與的探索性研究中，應用全基因組測序(WGS)與不完整的遺傳性疾病基因的覆蓋、檢測具有最高潛在臨床影響的基因變異的低復驗性，以及臨床報告發現的不確定性有關，盡管在某些案例中，WGS會發現基因變異株從而引入早期的醫療干預
震驚！全基因組測序還能這樣用在癌癥治療上？
近年來，隨著全基因組測序所需時間和成本的降低，個體化治療將造福更多的癌癥患者。近日發表于《Nature Medicine》的一項研究表明，開發新的機器學習算法對腫瘤全基因組序列信息進行分析，有助于預測患者的預后，幫助患者選擇最佳的治療方案。 全基因組測序（Whole-genome seque
關于全基因組測序的研究結果分析介紹
① 全基因組測序的研究結果— NCI-H209細胞系基因組中，共檢測到22,910個堿基替換、65個插入缺失（Indels）、58個結構變異；在基因組的編碼區，除了發現RB1 和TP53基因發生點突變和MLL2基因由于發生了G>T的顛換，從而產生了pre-stop codon外，有94個點突變直
PNAS:外顯子變異檢測——全基因組測序比全外顯子測序更強大
目前，全外顯子測序和全基因組測序技術在遺傳分析和發現導致疾病發生的潛在基因突變方面應用越來越廣泛，隨著測序技術的不斷迭代更新，越來越成熟，昂貴的價格會逐漸降低，那么在排除價格因素之后，全外顯子測序和全基因組測序在檢測外顯子突變方面究竟誰更加強大呢？來自美國的科學家對這一問題進行了相關研究，其研究
美國首次公布全外顯子測序參保標準－但對全基因組測序拒保
日前，美國保險公司Cigna公布了一項關于基因測序的新參保政策，該政策強調全外顯子測序（WES）和全基因組測序（WGS）的參保條件等問題。該政策由美國保險公司Cigna與InformedDNA公司的遺傳學專家共同制定，是美國國家健康體系首次發布全外顯子測序的參保標準。 全外顯子測序參保標準
花生基因組宣稱花生二倍體野生種全基因組測序完成
國際花生基因組計劃4月2日在美國弗吉尼亞州亞歷山大市宣布，包括中方合作單位在內的多國科研人員已經成功完成花生基因組測序，將為選育更高產、適應性更廣的花生品種提供幫助。 國際花生基因組計劃宣稱，花生全基因組測序取得的重大進展，分別代表花生屬A基因組和B基因組的兩個二倍體野生種的全基因組測序已
宏基因組測序技術助力腹瀉暴發調查中病原體識別
腹瀉病一直是世界范圍內主要流行和重要的致死性疾病之一，同時也是導致5歲以下兒童死亡和營養不良的第二大原因。不論在發達國家還是發展中國家，病原體導致的腹瀉是食品安全最主要的問題、以及人群健康的重要威脅。另外，雖然人類醫學條件得到了極大的提升，但因為腹瀉發病率高、病原體耐藥率高，使腹瀉病的治療和防控
甘肅對食源性疾病監測實現全覆蓋
新華社蘭州２月１６日專電（記者陳斌）隨著縣級食品安全檢驗檢測資源整合深入推進，甘肅省建成完善的省、市、縣、鄉四級食品藥品監管體系，實現食源性疾病監測縣區全覆蓋。 甘肅省食品藥品監督管理局介紹，目前甘肅省已全面推行網格化監管模式，四級食品藥品監管機構人員總編制共１０４５０名，到位率超過９０％
寄生蟲全基因組測序:為寄生蟲疾病提供新的解決方案
我們一直沒什么辦法研究頂復門寄生蟲所有基因的功能，”Whitehead研究所的Sebastian Lourido說。“現在我們找到了一個好方法。這種方法可以研究寄生蟲的各種問題，從獲取營養、應答免疫壓力到遺傳學互作，是相關領域的一次重要飛躍。”弓形蟲（Toxoplasma gondii）是一種寄生在
2015－cifsq－Jorgen－Schlund下一代測序和全基因組測序
分析測試百科網訊 2015年11月4-5日，中國國際食品安全與質量控制會議暨展覽（2015 cifsq）在京召開。會議由國際食品保護協會（iafp）主辦，北京訊息展信息技術有限公司承辦。新加坡南洋理工大學教授 Jorgen Schlundt 新加坡南洋理工大學教授Jorgen Sch
－NIH出資$3.13億用于疾病基因組測序研究
美國國立衛生研究院（NIH）將資助一些基因組測序分析中心，致力于破解人類常見病和罕見病的基因信息。NIH下屬的國家人類基因組研究所（NHGRI）14日宣布成立“常見疾病基因組學中心（CCDG）”，該中心將利用基因組測序技術，從基因水平研究心臟病、糖尿病、中風以及自閉癥等常見疾病產生的原因。NHG
英國將測序萬人基因組用于疾病研究
近日，在英國倫敦的科學博物館，維康基金會（Wellcome Trust）宣布了英國10K（UK10K）項目，即英國將在接下來的三年內測定10000個人的基因組序列。英國10K項目的負責人Richard Durbin表示，這項宏偉的計劃將得到生物醫學慈善會約1000萬英鎊的支持，10K項目旨在找出
全基因組分析發現多個疾病相關基因
來自倫敦帝國理工學院的研究人員通過多次全基因組關聯分析，發現了多個與疾病相關的基因，其中包括了糖尿病，冠心病等現代社會熱點關注的疾病，這些成果陸續發表在《Nature Genetics》，《JAMA》等雜志上。 第一篇文章中，研究人員找到了控制電信號，也就是控制心律的基因，這種被稱為SCN
全基因組分析發現多個疾病相關基因
來自倫敦帝國理工學院的研究人員通過多次全組關聯，發現了多個與疾病相關的基因，其中包括了糖尿病，冠心病等現代社會熱點關注的疾病，這些成果陸續發表在《Nature Genetics》，《JAMA》等雜志上。 第一篇文章中，研究人員找到了控制電信號，也就是控制心律的基因，這種被稱為SCN10A的基因受
復旦大學PNAS發表全基因組測序新發現
復旦大學上海醫學院高謙（Qian Gao）教授課題組的研究人員與來自中國、西班牙、瑞士等國的科學家們展開合作，在新研究中采用全基因組測序結合大規模基因分型揭示出了結核分枝桿菌北京家族菌株的起源、進化及其與現代人類遷移的聯系。這項研究發布在6月15日的《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志上。
小粒咖啡種質資源全基因組重測序解析獲進展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474824.shtm 隨著全球對特色咖啡需求的顯著增加，開發市場需求高的咖啡品種是必不可少的。近日，中國科學院武漢植物園的科研人員，通過基因組重測序等方式發現的SNPs，或與咖啡中重要農藝性狀的重要基