NCB|這一次,FTO是snRNA的m6Am去甲基化酶
RNA的m6A修飾是RNA表觀遺傳學研究領域的大熱門,近年來相關研究多次登上高分雜志。從胚胎發育到疾病進程,從RNA的穩定性到可變剪接和翻譯效率,m6A的功能幾乎無處不在(圖1)。圖1 由于m6A是一種RNA修飾,若想知道它在某一體系(發育階段或癌癥)中的作用,目前大部分研究都是基于影響m6A甲基化酶和去甲基化酶完成的。事實上,早在1974年,兩個研究組幾乎同時發現m6A在mRNA上富集【1,2】。而直到近十年,由于基于m6A的RNA測序MeRIP-Seq的開發【3】和m6A甲基化酶和去甲基化酶的鑒定,大家才意識到m6A是可逆的修飾,并且有方法去操縱它,也逐漸投入相關研究。 然而,隨著研究的深入,爭議也越來越多,甚至關于FTO是否是m6A去甲基化酶,目前尚無統一的定論(最近北大賈桂芳團隊和上海交大張良團隊合作解決了上述爭議,詳見BioArt今日發布的另外一條報道:PNAS丨賈桂芳/張良合作組揭示m6A去甲基酶FTO對底物......閱讀全文
如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關...(二)
2.4? m6A參與腫瘤免疫過程最初的文獻報道,m6A甲基化通過靶向IL-7/STAT5/SOCS軸參與調控T細胞穩態。Toll樣受體(TLRs)是內源性免疫系統中最保守的分子,是針對病原體的第一道防線。帶有m6A甲基化修飾的RNA分子不能活化部分TLR分子,這一過程導致TLR受體不能識別包含病毒核
如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶...1
如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測序研究,首發推出了超微量RNA
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用
最近小編檢索了關于m6A修飾的文章發表情況,發現目前2020年發表的關于m6A修飾的文章已經達到309篇,已經追平2019年整年度發表篇數,可以預見m6A RNA修飾下半年年發表文章會呈現出爆炸式增長。 圖1. 近6年m6A RNA修飾相關文章發表情況( data from PubMe
不得了,大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能,這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能輕松的變廢為寶,竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章,你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。 RNA甲基化,作為最新的國
小白必看!RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
RNA甲基化(RNA methylation)是一類表觀遺傳修飾,在已經發現的超過100種不同的RNA化學修飾中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenos
云序超微量MeRIP測序技術在m6A甲基化文章發表的應用2
3) m6A修飾與基因表達聯合分析通過m6A-MeRIP-seq和RNA-seq聯合分析,文章展示了m6A修飾水平與基因表達水平間的關系,統計發現表達高的基因分組中,受m6A修飾的基因比例也更高。4)甲基化相關酶的表達通過qPCR檢測了兩組樣品中6個甲基化相關酶的表達,發現在高度近視白內障患者中甲基
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能,這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能輕松的變廢為寶,竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章,你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作為最新的國自然熱點受到
基因組所等RNA甲基化表觀轉錄組學研究獲進展
2014年1月,中國科學院北京基因組研究所基因組變異與精準生物醫學實驗室“百人計劃”研究員楊運桂研究組,與中國科學院動物研究所“百人計劃”研究員劉峰研究組合作開展的“m6A甲基轉移酶復合物鑒定”研究,發現了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
基因組所等在RNA甲基化表觀遺傳新機制研究中獲重要進展
11月21日,中國科學院北京基因組研究所重大疾病基因組與個體化醫療實驗室 “百人計劃”研究員楊運桂研究組,與美國芝加哥大學何川教授實驗室和奧斯陸大學Arne Klungland教授合作完成的“RNA甲基化表觀遺傳新機制研究項目”取得重要進展,相關學術論文在《細胞》子刊《分子細胞》
SMAD2/3與TGFβ影響轉錄因子發生m6ARNA甲基化調控干細胞發育
文章導讀: 胚胎干細胞作為一種全能性細胞,通過增殖和分化,產生動物體所有組織和器官的細胞。已有研究表明,胚胎干細胞發生m6A RNA甲基化,大多與細胞增殖[1-2],免疫應答[4]關系密切。然而,對于m6A修飾在胚胎干細胞向神經內胚層細胞分化過程中的分子機制目前并沒有相關報道。今天,分享一
如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶...2
1)轉移性HCC當中,METTL3調控的m6A修飾可以影響DGCR8對pri-miRNA加工過程。METTL14也可以通過調控DGCR8識別或者結合pri-miRNA的過程來影響pri-miRNA的加工成熟,實驗證明METTL14的敲除會導致pri-miR126的加工停滯,成熟miR126表達量的下
SUMO化修飾調控m6A-RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一種...
SUMO化修飾調控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一種全新分子機制RNA甲基化是目前最炙手可熱的研究領域,近3個月以來,該方向影響因子10分以上的文章數量竟接近20篇。云序生物曾對RNA甲基化研究方法及思路進行了深度剖析,感興趣的老師可瀏覽云序生物前期公眾號(2018國自然熱點二:R
如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關...(一)
如何做到快速同時檢測各類癌癥當中RNA甲基化相關酶&RNA甲基化水平RNA甲基化作為云序生物的主打科研產品,已經幫助多個研究團隊展開了RNA甲基化研究。作為國內RNA甲基化研究的領跑者,云序生物是國內RNA甲基化10分文章發表的成熟服務商,首發推出了非編碼RNA甲基化測序研究,首發推出了超微量RNA
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用
表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形成,還有文章探究過其在急性白血病中的作用,但其對胰腺ai的影響還缺乏研究。今年5月份發表在Molecular
2019年,大牛們都在研究什么?—m6A文章盤點
19年悄悄的已經將近過半,但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相關文章發表;造血干細胞分化,癌細胞上皮間質轉化,樹突細胞活化,心肌細胞肥厚,內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
云序RNA修飾技術余義勛課題組植物m1A修飾調控機制的運用
導讀 RNA甲基化修飾在調控生物生長發育的過程中起重要作用,m6A和m5C在植物體內的產生機制和生物學功能已有較多研究論文發表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修飾在植物中的研究還非常少。 近日,Plant Physiology 在線發表了華南農業大學余義勛課題組題為“The
RNA修飾技術在華南農大余義勛組植物m1A-調控機制的運用
RNA甲基化修飾在調控生物生長發育的過程中起重要作用,m6A和m5C在植物體內的產生機制和生物學功能已有較多研究論文發表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修飾在植物中的研究還非常少。 近日,Plant Physiology 在線發表了華南農業大學余義勛課題組題為“The N1-met
新型全轉錄組單堿基分辨率N6甲基腺苷(m6A)檢測方法
在已知的100多種RNA化學修飾中,N6-甲基腺苷(m6A)是真核細胞mRNA中最豐富的形式之一,占所有腺苷的0.1%~0.4%。m6A修飾可影響mRNA代謝的不同階段以及長非編碼RNA和microRNA產生,是RNA和表觀修飾領域的重要研究方向。已有研究表明,m6A能夠影響多種生物學過程,包括
云序RNA修飾技術在華南農大余義勛課題組植物m1A修飾...2
2. m6A甲基轉移酶METTL3的泛素化調節其功能??發表期刊:Nucleic Acids Research影響因子:11.147發表日期:2018.06.01實驗方法:?m6A-seq,RNA-seq,MeRIP-PCR,RIP等(云序提供)??上海交通大學醫學院余健秀組在著名期刊《核酸研究》發
甲基化——腫瘤檢測治療的又一靶標?
前言在測序和相關技術不斷進步的今天,研究人員不僅能夠獲得DNA、RNA的堿基序列,更能夠獲得堿基修飾的復雜信息。目前已經證明DNA甲基化能夠導至的腫瘤產生,而Ribomed、基準醫療和鹍遠基因等公司作為該領域的先行者,已經開發出相關產品。RNA作為中心法則的下游分子,也有多種多樣的修飾,特別是m6A
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(四)
1)m6A修飾PCR芯片?new!云序生物提供m6A修飾PCR芯片檢測,高效一次性檢測m6A相關的Writer,Eraser,Reader的表達情況,m6A PCR 芯片基因列表(34 個基因)-human如圖:??2)RNA修飾PCR芯片?new!云序生物提供多種RNA修飾PCR芯片檢測,高效一次
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(一)
導讀最近小編檢索了關于m6A修飾的文章發表情況,發現目前2020年發表的關于m6A修飾的文章已經達到309篇,已經追平2019年整年度發表篇數,可以預見m6A RNA修飾下半年年發表文章會呈現出爆炸式增長。?圖1. 近6年m6A RNA修飾相關文章發表情況( data from PubMed)那么您
Nature-|-m6A-RNA甲基化識別蛋白YTHDF1參與記憶的形成
目前來說,調控m6A修飾過程的閱讀蛋白共有9種功能,今天不會大家一一來講,而是主要講參與蛋白編碼過程的YTHDF1蛋白,它主要通過與mRNA的m6A位點結合,在腦神經發育[1],多巴胺分泌[2]和突觸形成[3]等過程中起重要作用。 文章導讀: 2018年10月31日,美國芝加哥大學何
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(二)
為了進一步說明Mettl3在CRC糖酵解過程中促進腫瘤發展的作用,作者通過RNA-seq(云序可提供此服務)分析比較Mettl3 KO和野生型的細胞(WT HCT116 CRC)基因表達情況。通過GO和KEGG分析,WT HCT116主要富集與葡萄糖代謝相關的信號通路,而Mettl3 K
m6A-RNA甲基化在發表多篇10+文章的運用(三)
(5)酶METTL3作用分子機制研究已表明Mettl3是一種甲基化轉移酶,可以調控靶分子的甲基化水平,那么是如何調節糖代謝過程呢?現有實驗已表明Mettl3敲除或過表達不僅影響HK2和SLC2A1的甲基化水平,還調節HK2和SLC2A1的表達水平,這暗示著靶分子甲基化水平影響其表達,而雙熒光素酶實驗
一文了解RNA甲基化機制
1. 什么是RNA甲基化修飾? 我們知道DNA的甲基化修飾是發生在胞嘧啶(C)上的,而最常見的RNA的甲基化修飾是m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)和尿苷化修飾(uridylation,U-tail)。 m6A修飾在70年代就發現了,是可以發生在mRNA、lncR
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用
文章導讀 表觀遺傳修飾如m6A甲基化在腫 瘤的發生和發展中起到重要作用。而甲基化酶對ai癥的影響也受到廣 泛關注。其中去甲基化酶ALKBH5已被報道過能通過維持乳腺ai細胞的干細胞性而促進腫 瘤的形成,還有文章探究過其在急性白血病中的作用,但其對胰腺ai的影響還缺乏研究。今年5月份發表在M
2019年,大牛們都在研究什么?—m6A文章盤點
19年悄悄的已經將近過半,但RNA甲基化研究馬不停歇。單單過去一個半月的時間里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相關文章發表;造血干細胞分化,癌細胞上皮間質轉化,樹突細胞活化,心肌細胞肥厚,內源性免疫應答調控都有它的身影。這里小編給大家列舉展示幾篇最新的m6A RNA甲基化研究成
陳建軍/楊建華/何川/黃剛-揭示RNA-m6A由組蛋白修飾決定
近年來,RNA表觀遺傳學的研究發現RNA甲基化修飾,特別是m6A甲基化修飾,在哺乳動物的轉錄組中廣泛存在,并且在多種生理和病理過程中發揮著重要的生物學功能,引領了RNA以及表觀遺傳學領域的又一個熱潮。高通量測序揭示在人和小鼠的轉錄組中有1/3-1/2的mRNA轉錄本具有m6A修飾【1,2】。理論
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的應用(三)
總結本文作者通過RNA-seq,?m6A-seq,?MeRIP-qPCR,?ChIP,?CoIP,雙熒光素酶實驗等方法,研究發現去甲基化酶ALKBH5缺失會加重胰腺ai的發生和不良臨床病理表現特征。ALKBH5的過度表達可降低了體外腫 瘤的增殖、遷移和侵襲活性,改善了體內腫 瘤生長,而ALK