NEJM發布基因組和外顯子組測序的臨床指南

　　誰也沒想到基因組測序技術這么快就進入了臨床實踐。現在，已經不少醫生在測序的幫助下解決了之前難以確診的疾病，尤其是罕見的兒童疾病。兩位著名學者在六月十九日的《新英格蘭醫學》雜志上發表文章，為醫生們提供了測序臨床應用的入門指南，幫助他們更有效的利用這一新技術。

　　 “這篇文章為醫生們提供了可以遵循的基本準則，”美國國立人類基因組研究所（NHGRI）的主管Eric D. Green博士說。文章的作者是NHGRI的Leslie G. Biesecker和哈佛醫學院的Robert C. Green。

　　文章指出，現在已經有數千名醫生為患者制定了基因組或外顯子組（CGES）測序的臨床方案。據Biesecker估計這樣的檢測今年將達到一萬例，明年還會有更多。

　　“人類基因組計劃所用的先進技術，已經成為了診斷和治療的實用工具，”Dr. Biesecker說。“十年前人們肯定無法想象，基因組或外顯子組測序能夠用于數以萬計的患者。”

　　去年NEJM上發表的一項研究顯示，大約有25%的患者通過外顯子測序找到了遺傳病因。測序技術已經幫助人們鑒定了多種疾病的致病突變，包括腓骨肌萎縮癥（Charcot Marie Tooth disease）、智力障礙、神經疾病、代謝疾病、癲癇、心肌病、癌癥和肌萎縮側索硬化（ALS）。

　　“將基因組測序整合到醫療程序中，是醫學史上的一個重要轉折點，”MedSeq?計劃的領導者Dr. Robert Green說。“我們這篇文章主要針對的是，用測序技術確診疑難雜癥，而這還只是個開始。測序技術可以幫助我們將醫療變得更加個性化，實現更好的預防性護理。”

　　醫生們首先需要理解的是，外顯子測序不能回答所有的疑問，也不一定對每個人都適用。這篇文章為醫生提供測序之前需要了解的必要信息，指引他們在測序的幫助下確診疾病。例如：

　　?盡管被稱為全基因組或全外顯子祖測序，但這些技術并不能百分百覆蓋基因組或外顯子組。基因組或外顯子組測序最適合檢測單核苷酸突變，或者不超過8-10bp的序列變動，不適用于致病性的重復序列或者長片段刪除。

　　?因為單基因突變患上某種罕見疾病的患者，最能夠從這些測序技術中獲益。醫生們在制定外顯子測序計劃之前，應該先分析患者的家族病史，并廣泛查閱相關文獻。當然，患者還要先簽署知情同意書。

　　?外顯子組測序并不意味著就一定可以確診。從平均數據來看，大約只有25%的測序確診了致病突變，在大多數情況下并為提供足以確診的信息。而且因為外顯子測序并未覆蓋全部序列，陰性結果也不一定能完全排除某種遺傳學病因。

　　?絕大多數情況下，找到致病突變并不意味著能夠治愈患者。即便如此，外顯子測序仍然很有用。難以確診的疾病往往需要昂貴而漫長的篩查，而外顯子測序可以在短時間內結束這個折磨人的過程。

　　?分析測序數據可能獲得意外的收獲，例如，發現與主要病癥無關的致病突變。這時醫生們可以根據需要對患者進行醫療監控，或者采取必要的治療措施。

　　?當測序未能得出確定結論時，患者們往往會大失所望。因此，幫助患者及其家人正確看待測序結果是很重要的。

　　“我們認為，如果醫生們愿意去花時間去了解這些技術，就會愿意使用它們，” Dr. Biesecker解釋道。

　　Biesecker總結道，在選擇進行測序之前，醫生們必須先了解哪些疾病適合測序，什么樣的家族病史意味著單基因疾病，在測序提供了幾個潛在致病基因時應該怎樣解讀。

　　有人認為，將基因組和外顯子測序用于臨床的時機還未成熟，很多醫生還沒有充分意識到這種技術的優點和不足。作者們指出，不論時機成熟與否，已經有醫生在為患者提供基因組和外顯子組測序，而測序在臨床上的使用只會越來越多。