闡明介導子如何與TFIID串擾促進啟動子-增強子之間的交流溝通對于揭示增強子功能的機制非常重要;近日,一篇發表在國際雜志Genes & Development上題為“The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator binding but not promoter–enhancer looping”的研究報告中,來自加利福尼亞大學醫學院等機構的科學家們通過研究發現,名為轉錄因子TAF12的關鍵蛋白或在始發前復合體(preinitiation complex)的形成過程中扮演關鍵角色,這種始發前復合體包括了對蛋白編碼基因轉錄所必需的100多個蛋白質,研究者還發現,通過消除TAF12蛋白就能破壞完整的始發前復合體,而且全基因組的轉錄也會被大幅下調。
本文研究結果或為靶向作用TAF12的癌癥療法的開發鋪平了道路,并能潛在阻斷癌細胞的轉錄以及降低癌變腫瘤的生長,此前研究人員發現,TAF12對于小鼠模型急性髓性白血病的進展至關重要。Michael Carey博士說道,識別出TAF12是始發前復合體的基石對于幫助我們促進對細胞中始發前復合體的消除至關重要,這在此前是并沒有過的。
在過去幾十年里,科學家們關于基因組如何被組裝的機制以及對轉錄因子的結構的理解取得了重要的進展和進步;然而,增強子如何預啟動子相互作用來開啟基因表達的詳細細節,研究人員卻并不完全清除,啟動子是一種能控制人類和小鼠機體基因組轉錄的關鍵遺傳元件。有效的轉錄需要形成一種始發前復合體,而該復合體有100多個轉錄因子,其中包括兩個稱之為共激活因子的復合體,轉錄是機體中在制造蛋白質過程中扮演重要角色的基本生物學過程。
理解細胞中這兩種主要的共激活因子的功能對于確定基因激活的精確機制是非常重要的,本文研究中,研究人員通過研究在共激活因子中識別出了關鍵蛋白,來觀察是否關于基因調節和轉錄的知識是否最終會應用到癌癥治療過程中去。此外,研究人員還進行了一項shRNA基因敲除篩查來識別小鼠胚胎干細胞中基因轉錄過程中的關鍵蛋白,隨后他們采用了一種名為“生長素誘導降解技術”(auxin-inducible degradation)的方法來快速移除所識別的轉錄因子,從而就能確定其對整個基因組中始發前復合體形成的影響效應。
綜上,本文研究結果表明,TAF12和MED4能以不同的方式對啟動子-增強子之間的交流溝通產生機械性上的貢獻,但這兩種因子似乎都沒有直接控制啟動子-增強子循環,從而就會使得其二者之間的通訊與物理循環相分離。
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