3月28日《自然》雜志內容精選

　　不用晶體的晶體結構分析

　　X射線衍射是一種強大的分析方法，但它也有一個限制其應用的缺點：分析的目標需要是晶體。這篇論文介紹了一個新的X射線分析方法，它不需要樣品本身的晶體化，而是用被稱為“金屬有機網絡”的晶體“海綿”來吸收含有目標分子的一滴液態客體。這種“海綿”含有微孔，能識別目標分子，并以一個有序陣列的形式結合它們，從而使得能夠對所吸收的客體連同主體框架一起進行晶體學結構分析。這種方法通過對一種稀有天然產物的“絕對結構確定”得到了演示。該天然產物即Miyakosyne A，樣品用量很少，只有5克。

　　與神經退化相關的RNA代謝

　　哺乳動物RNA激酶CLP1是在近5年前首次發現的，當時其在活體中的功能并不清楚。自那時以來，RNA代謝已走到了生物學的前沿，而現在，研究人員利用基因剔除小鼠發現，CLP1在運動神經元中發揮作用。CLP1激酶失活的小鼠表現出進行性脊髓運動神經元喪失、周圍神經退化和運動功能受損，最終導致呼吸衰竭。CLP1活性的失去導致由酪氨酸pre-tRNA的異常處理所產生的小RNA片段的積累。這些tRNA片段使細胞對由氧化應激誘導的p53激活和p53依賴性細胞死亡變得敏感。p53的遺傳滅活可防止突變小鼠出現CLP1滅活的神經肌肉特征。這些數據顯示了tRNA處理、一種新的RNA和“下運動神經元”由p53調控的進行性喪失之間一個以前人們不知道的聯系。這些發現也許能幫助解釋如“肌萎縮性側索硬化癥”和“脊髓性肌萎縮”等疾病的分子基礎。

　　深海中蛋白石和二氧化碳釋放

　　南大洋被認為在推動大氣二氧化碳濃度的冰期/間冰期變化中發揮一個重要作用，但造成冰川消失時二氧化碳釋放的機制仍不清楚。根據有關生源蛋白石輸出的一份記錄（該記錄顯示在過去55萬年每次冰期終止時蛋白石的最大值），Nele Meckler等人提出，冰河期北大西洋中層水在冰消期的減少導致溫暖的、低密度的表面水向下混合，最終觸發南極海水翻轉和二氧化碳向大氣層的釋放。

　　伯吉斯頁巖中的囊舌蟲

　　“囊舌蟲”是生活在泥土中的生物，其生活范圍從前灘延伸到深海。它們與“羽鰓類”動物相關，后者是小型的、群居的、在管中生活的動物，從表面上看完全不同。二者都與棘皮動物（海星及同類）和脊索動物（包括人類自己在內的動物類群）有關。Jean-Bernard Caron及其同事在這篇文章中介紹了來自加拿大卑詩省著名“寒武紀伯吉斯頁巖”的“囊舌蟲”化石。它們看起來非常像一些現代“囊舌蟲”，但生活在管子中，更像現代“羽鰓類”。這一發現增加了化石動物群落的多樣性，也為“囊舌蟲”和“羽鰓類”的共同祖先是什么樣子提供了線索。它也許還能推動有關脊索動物的祖先是一種自由生活的蠕蟲還是一種固定、群居生活的動物的辯論。

　　迎面碰撞推動基因演化

　　大多數細菌基因是編碼在先導復制鏈中的，這可能是為了避免當基因被編碼在拖后復制鏈上時在復制機構和轉錄機構之間會發生的有害迎面碰撞。本文作者報告說，枯草桿菌17%的核心基因在拖后鏈上，它們比先導鏈上的那些基因在同一氨基酸位置上發生“點突變”和“收斂變化”的比例要高一些。考慮到基因長度和基因表達水平，本文作者提出：迎面復制—轉錄沖突比同向沖突更易誘發突變，而且細菌（也許還包括其他生物）可能會將迎面復制—轉錄沖突用作某些基因的定向適應性演化的一個機制。

　　與核內體相關的腎上腺素受體信號作用

　　人們普遍假設，G-蛋白相關信號作用只發生在胞質膜上。在這項研究中，Mark von Zastrow及其同事利用構形特異性單鏈抗體來直接探測β2-腎上腺素受體（它是一種典型的G-蛋白耦合受體）及其同源G蛋白Gs在活細胞中的激活。他們發現，經典的或非經典的G-蛋白相關信號作用既能在胞質膜上發生，也能在核內體上發生。

　　早期鳥類仍然非常像恐龍

　　對來自中國中生代新發現的原始鳥類化石所作的分析，為了解鳥類繁殖能力的演化打開了一扇窗戶。距今超過1.2億年的這些材料是三只母鳥的，也是卵巢軟組織得以保留下來的第一批化石材料。這些化石顯示，鳥類從其演化過程中非常早的一個時期開始在任何給定時間都只有一個能發揮功能的卵巢，但其骨骼和性成熟的其他特征都仍然非常像恐龍。