2016年諾貝爾生理學或醫學獎揭曉,來自東京工業大學的大隅良典Yoshinori Ohsumi因發現自體吞噬的機制而獲得此獎,他的代表論文包括:
Autophagy in yeast demonstrated with proteinase-deficient mutants and conditions for its induction
這篇論文是Ohsumi獲得諾貝爾生理或醫學獎的關鍵成果,即證實了酵母的自噬過程。
液泡是一個細胞器,相當于人體中的溶酶體。酵母細胞比較容易研究,因此它們經常被用來作為人類細胞的模型。尤其是用來鑒別對復雜細胞途徑非常重要的基因方面特別有用。酵母細胞非常小,內部結構在分辨顯微鏡下也不容易看到,因此Yoshinori Ohsumi 也不確定酵母體內是否存在自噬。自噬過程是活躍的,如果他能擾亂液泡中的降解過程,那么自噬體會在液泡中積累,從而在顯微鏡下可見。
因此Ohsumi培養了液泡降解酶缺乏的突變酵母,同時慢慢地刺激發生自噬,結果是驚人的。不到一個小時,液泡中充滿了未退化的小囊泡,就是自噬體。他的實驗證明了酵母中存在自噬。更重要的是,他有一個方法來驗證和表征這個過程中的關鍵基因。
Isolation and characterization of autophagy-defective mutants of Saccharomyces cervisiae
隨后,Ohsumi 開始利用他構建好的酵母基因工程菌開展進一步研究。如果對自噬有影響的基因失活,那么這個自噬體積累過程不會發生。他將酵母細胞暴露中化學物質中來實現對一些基因的隨機突變,然后他誘導了自噬,結果奏效了。
這篇論文就是hsumi發現酵母中存在自噬的一年后,發現了和自噬有關的第一個基因,在他隨后的研究中,由這些基因編碼的蛋白被表征,其研究組通過篩選上千個酵母的突變株,鑒定了15個和自噬有關的關鍵基因。
Analyses of APG13 gene involved in autophagy in yeast, Saccharomyces cerevisiae
a novel protein kinase required for the autophagic process in Saccharomyces cerevisiae
這兩篇1997年的文章在釀酒酵母中克隆出了兩個自噬調控基因,開啟了自噬的分子研究時代。
A protein conjugation system essential for autophagy
這篇論文對于Ohsumi獲獎也至關重要——他發現了ATG12-ATG5 自噬通路。
許多蛋白質協同作用形成自噬體是自噬過程的一部分,ATG12和ATG5這兩種蛋白正確連接可形成一種稱作自噬小體(autophagosome)的細胞器。自噬體可像垃圾袋一樣移除有毒物質,通過再循環向細胞提供營養物質。
LC3, a mammalian homologue of yeast Apg8p, is localized in autophagosome membranes after processing
同時Ohsumi等人還發現了自噬小體(autophagosome)的標志性蛋白 LC3-II。LC3是自噬系統的一個關鍵蛋白,來吞噬樁蛋白,并將其運輸到溶酶體,在那里它被降解。
LC3 蛋白有兩個形式,正常狀態下以 LC3-I 的形式存在,自噬發生的時候,LC3-I 發生脂化和剪切形成 LC3-II。 LC3-II 移位到自噬小體上,成為目前自噬細胞研究的標志性檢測蛋白。
附:如何檢測原代細胞中的自噬
自噬是個復雜的過程。在哺乳動物中,Atg8家族的8個成員被鑒定出。最為人熟知的是LC3,這是大多數經典的自噬檢測分析中的關鍵分子。LC3的脂化導致LC3(LC3-II)在western blot中比非脂化形式(LC3-I)跑得慢,因此可以檢測。當自噬水平低時,LC3-I均勻分布在細胞中,而一旦自噬發生,LC3的脂化導致其重新定位到自噬體上,這可以通過免疫熒光顯微鏡來觀察。第三種經典方法就是利用電鏡來觀察雙膜的囊泡。
還有一些注意事項。比如,在檢測原代細胞混合物中一種細胞的自噬時,需要進行細胞分選。然而,磁珠或流式細胞儀的分選會誘導自噬的形成,導致難以分辨。這時可利用ImageStream成像流式細胞儀來鑒定細胞類型,并同時測定自噬,從而避免分選。
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