黃芩苷通常被認為是安全的，但在某些情況下可能會對神經系統產生一定的影響。這些影響可能包括：
頭痛：部分人在服用黃芩苷后可能出現輕度頭痛。
頭暈：黃芩苷可能導致血壓下降，從而引起頭暈。
嗜睡：雖然較為罕見，但有報道稱黃芩苷可能引起嗜睡。
近期，河北省中藥研究與開發重點實驗室，承德醫學院中藥研究所研究人員發表論文，旨在分析比較高效液相色譜-二極管陣列檢測器-質譜（HPLC-DAD-MS）法和高效液相色譜-二極管陣列檢測器（HPLC-DA......
100μg/mL黃芩苷預處理顯著減少硫酸粘桿菌素誘導的細胞核固縮和DNA片段化現象從干燥的黃芩根中提取的黃芩苷具有抗氧化、清除氧自由基等的藥理作用，研究顯示其對β淀粉樣蛋白誘導神經元損傷也有保護作用，......
本方法采用高效液相色譜法測定一清滴丸中黃芩苷的含量。本方法適用于由由大黃、黃連和黃芩等組成的滴丸。......
本方法采用高效液相色譜法測定小兒熱速清顆粒中黃芩苷的含量。本方法適用于小兒熱速清顆粒中黃芩苷的含量測定。......
本方法采用高效液相色譜法測定三黃片中黃芩苷的含量。本方法適用于由由大黃、鹽酸小檗堿和黃芩浸膏等組成的片劑。......
本方法采用高效液相色譜法測定九味羌活丸中黃芩苷的含量。本方法適用于由羌活、防風、蒼術、黃芩、川芎、地黃和細辛等藥味組成的濃縮丸制劑。......
本方法采用高效液相色譜法測定雙黃連顆粒中黃芩苷和連翹苷的含量。適用于中成藥雙黃連顆粒。......
本方法采用分光光度法測定黃芩苷及綠原酸的含量。適用于中成藥雙黃連栓。......
本方法采用分光光度法測定銀黃口服液中綠原酸(C16H18O9)和黃芩苷(C21H18O11)含量。適用于中成藥銀黃口服液。......
本方法采用二階導數光譜測定法測定銀黃口服液中黃芩苷(C21H18O11)的含量。適用于中成藥銀黃口服液。......