一般來說有三種可能性，也是三種解決方法。
確實是兩種物質，極性相近，保留時間相近。如果是這樣的話只能是調整試驗方法，把他們分開。比如調整有機相比例，調整水相pH值等。不行的話還需要跑梯度或者更換色譜柱。
色譜柱不行了。色譜柱使用時間久了，里面的填料就臟了。有時候會出現類似于包峰的肩峰。你可以換一根新的色譜柱試試，如果新的色譜柱峰型是好的，那么你的舊柱子就不行了。你可以小流速反沖純有機相再生一下。不行的話就真的是不行了。
溶劑問題導致的。很多時候反相體系的試驗，試驗員喜歡用純有機相或者純水配制樣品。當然有時候是沒問題的，但有時候就會出現包峰。這是因為樣品中的pH值和極性與流動相的pH值和極性不同的緣故。你可以把溶劑換成流動相試一下看看情況。