1、吲哚試驗（Indol test）：含有色氨酸酶的細菌（如大腸桿菌、變形桿菌等）可分解色氨酸生成吲哚，若加入二甲基氨基苯甲醛，與吲哚結合，形成玫瑰吲哚，呈紅色，稱吲哚試驗陽性。
2、硫化氫試驗：變形桿菌、乙型副傷寒桿菌等能分解含硫氨基酸如胱氨酸、甲硫氨酸等，生成硫化氫。在有醋酸鉛或硫酸亞鐵存在時，則生成黑色硫化鉛或硫化亞鐵，可借以鑒別細菌。
3、尿素分解試驗：
變形桿菌具有尿素酶，可分解尿素產生氨，培養基呈堿性，以酚紅為指示劑檢測呈紅色，由此區別于沙門氏菌。
吲哚（I）、甲基紅（M）、VP（V）、枸櫞酸鹽利用（C）四種試驗，常用于鑒定腸道桿菌，合稱之為IMViC試驗。大腸桿菌呈“++--”，產氣桿菌為“--++”。
氣相、液相色譜法通過對細菌分解代謝產物中揮發性或不揮發性有機酸和醇類的檢測，可準確、快速地確定細菌的種類，是進行細菌生化鑒定的高新技術。
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