長非編碼RNA(lncRNA)是一些長度超過二百個核苷酸的RNA分子,來自于基因組的非編碼區域。雖然lncRNA沒有編碼任何蛋白質,但它們在不同組織和發育階段的表達依然具有特異性,這說明lncRNA具有重要的生物學意義。在測序技術的幫助下,人們已經發現了數千種lncRNA,但這些lncRNA的生物學功能依然還是個謎。
人們發現,有些lncRNA通過RNA-蛋白互作招募調控復合物,進而影響附近基因的表達。可能正是因為這個原因,lncRNA表達往往與附近基因的表達相關。不過,這種關聯分析起來并不容易。Broad研究所的科學家們最近在這方面取得了重要成果。他們在Nature雜志上發表文章揭示了lncRNA對基因表達的本地調控機制。文章通訊作者是著名遺傳學家、美國科學院院士Eric S. Lander教授。Lander教授是Broad研究所的創始人,也是人類基因組計劃主要負責人之一。
研究人員對小鼠細胞系進行基因操縱,分析了十二個生產lncRNA的基因組位點。研究顯示,其中五個位點順式影響附近基因的表達。值得注意的是,這些影響不需要lncRNA轉錄本本身,而是與lncRNA生產過程有關,比如啟動子活性、轉錄過程和轉錄本剪接。
進一步研究表明,蛋白編碼位點也能影響附近基因的表達。六個蛋白編碼位點中有四個會對附近基因產生影響。這說明相鄰基因的交流是一種普遍現象,涉及多種機制和順式調控信號。
中科院生物物理所的科學家們對肝癌進行深入研究,鑒定了一種支持肝癌干細胞自我更新的lncRNA(lnc-β-Catm)。這項重要研究成果于五月三十日發表在Nature Structural & Molecular Biology雜志上,文章通訊作者是中科院生物物理所的范祖森(Zusen Fan)研究員。
加州大學研究團隊在人類新皮層的發育過程中,對長非編碼RNA進行了單細胞分析。他們在四月十四的Genome Biology雜志上發表文章指出,lncRNA在新皮層特定細胞中起到了重要的作用。該雜志還同時刊發了華裔牛人Howard Y. Chang為這項研究成果撰寫的點評。
人們普遍認為lncRNA具有重要的生物學意義,但對它們的具體功能還知之甚少。賓夕法尼亞大學的科學家們對一種備受關注的lncRNA進行了研究。他們在Molecular Cell雜志上發表文章指出,這種lncRNA很可能并沒有什么功能,真正起作用的是其編碼DNA。這個DNA片段能像增強子那樣激活附近的蛋白質編碼基因。
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