主要為對癥支持治療。注意休息、營養，對體弱年幼小兒，支持療法很重要。加強護理，防治繼發感染。有驚厥者應給予鎮靜藥。若無菌性腦膜炎綜合征是由細菌感染引起的，應給予特效的抗生素治療。動物實驗證明激素可加重腸道病毒感染，故不主張用激素。
病毒引起者，在早期可使用干擾素治療。
