1、1-3周內有不潔性交史，或配偶有感染史。不潔性交史、潛伏期及癥狀。
2、尿道分泌物涂片及培養排除淋球菌、念珠菌及其他細菌感染。涂片有大量白細胞，10-15個以上/400倍，5個以上/1000倍顯微鏡檢。
3、尿道分泌物或宮頸刮片，單克隆衣原體熒光抗體檢查或培養。標本取法：男性2h以上不排尿，棉拭子插入尿道2-4cm，輕輕旋轉5s，放置2-3s，然后取出培養。女性用窺陰器充分露暴宮頸，第一根拭子將宮頸表面分泌物擦掉，第二根拭子插入宮頸1-2cm，旋轉10s，停2-3s，取出拭子，不要碰陰道壁。