1.貧血表現
維生素B12缺乏者起病多隱匿，表現有乏力、頭暈、活動后氣短、心悸、面色蒼白，嚴重貧血者可有輕度黃疸，可同時有白細胞計數和血小板少，患者偶有感染及出血傾向。
2.胃腸道癥狀
如食欲減退、腹脹、腹瀉及舌炎等，以舌炎最為突出，舌質紅、舌乳頭萎縮、表面光滑，俗稱“牛肉舌”，伴疼痛。
3.神經系統癥狀
維生素B12缺乏者常伴有神經系統表現，尤其是惡性貧血的患者。主要是由于脊髓后、側索和周圍神經受損所致。表現為乏力、手足對稱性麻木、感覺障礙、下肢步態不穩、行走困難。小兒及老年人常表現腦神經受損的精神異常、無欲、抑郁、嗜睡或精神錯亂。部分患者的神經系統癥狀可發生于貧血之前。
上述三組癥狀在惡性貧血患者中可同時存在，也可單獨發生。同時存在時其嚴重程度也可不一致。