SFC可彌補GC和HPLC在分析性能上的某些不足，分離效能和分析速度介于兩種色譜方法之間。
SFC可分析不宜用GC分析的一些物質，如強極性、強吸附性、熱穩定性差、難揮發的化合物；
它可分析相對分子質量比GC大幾個數量級的物質。
SFC可分析HPLC難以檢測的各種化合物，如無紫外吸收的各種天然產物、高分子聚合物。
現在SFC已用于分離分析脂肪酸甘油酯、類脂物、膽固醇、膽汁酸、脂溶性維生素、氨基酸、多肽、石油中高級脂肪烴（>C100)、高級脂肪醇、烴基聚硅氧烷、聚乙二醇、聚醚、金屬有機化合物、聚烯烴等。