磷對海洋生物的危害海洋生物大多對有機磷農藥十分敏感，一些耐藥性昆蟲毫無反應的農藥濃度，很快能夠使海洋生物致死。早在1999年12月青島海洋大學教授李永祺就曾在報告中說，目前國內外廣泛使用的有機磷農藥對海洋生物危害巨大，已經對海水養殖業形成威脅。 我國農業生產中曾經廣泛使用的有機氯農藥，但因其殘留長、不易降解和強附著力，已在20世紀70年代停用。由于有機磷農藥有毒效大、易分解的特點，從而很快取代了有機氯在農藥中的地位。這直接導致了沿海水域因有機磷農藥污染而造成的魚、蝦、蟲類等死亡事件層出不窮。 李永祺教授通過對有機磷農藥對蝦、魚、貝、藻的毒性效應及其機理的研究，發現能造成我國對蝦大規模死亡的原因之一，就是有機磷污染激活對蝦體內潛伏的病原體。
磷對土壤的危害所謂的土壤污染就是向土壤中排放的物質超過了其本身的自凈能力，土壤質量發生了不良變化，危害了人類健康和生存。如今，隨著人類活動范圍和深度的增大，各種物質輸入土壤的數量與速度也大大增加了，這就超過土壤的自凈能力，破壞了自然生態平衡。污染物質逐漸積累，導致了土壤自然正常功能失調。更為嚴重的是，由于土壤污染物質的遷移轉化，毒化空氣和水質；或通過植物吸收，降低農副產品的生物學質量，造成殘毒通過食物鏈傳遞最終危害人類的生命和健康。甚至造成土壤的板結、堿化和沙化，使土壤喪
失了提供農作物生長的必要條件。 磷對土壤的污染主要是人為污染，來源于人類過量施用農藥、化肥及污水灌溉等。
磷對天然水體的危害天然水體中由于過量營養物質(主要是指氮、磷等)的排入，引起各種水生生物、植物異常繁殖和生長，這種現象稱作水體富營養化。這些過量營養物質主要來自于農田施肥、農業廢棄物、城市生活污水和某些工業廢水。城市生活污水中含有豐富的氮、磷，使用含磷洗滌劑，含有大量的磷等。另外如磷灰石、化肥、農藥的大量使用，磷等營養物質進入水體的來源。氮、磷是藻類繁殖所需的各種成分中的限制性因素，因此水體中氮、磷含量的高低與水體富營養化程度有密切的關系。一般地說，無機氮和總磷分別超過300mg/m3和20mg/m3就認為水體處于富營養化狀態。而對于引發水體富營養化而言，磷的作用遠大于氮的作用，水體中磷的濃度不很高時就可以引起水體的富營養化。 湖泊的富營養化是一人自然過程，在自然界物質的正常循環中，這一歷程需要很長的時間，需幾萬年甚至幾十萬年。但由于水體污染而造成的富營養化將大大促進這一過程。如果氮、磷等植物營養物質大量而連續地進入湖泊、水庫及海灣等緩流水體，將促進各種水生生物的活性，刺激它們異常繁殖(主要是藻類)，這樣就帶來一系列嚴重后果：瘋長的藻類會在水面越長越厚，終于有一部分被壓在了水面之下，因難見陽光而死亡。湖底的細菌以死亡藻類作為營養，迅速增殖。大量增殖的細菌消耗了水中的氧氣，使湖水變得缺氧，依賴氧氣生存的魚類死亡，隨后細菌也會因缺氧而死亡，晟終是湖泊老化、死亡。震驚全國，攪得無錫近人生活不得安寧的太湖藍藻事件就是湖泊富養化的典型例子。它的形成原因就是周力化工企業大量的含磷、氮的污水的排放引起的。