發病機制
正常口腔中的念珠菌是與之競爭的細菌控制之下，只有在宿主的抵抗力被削弱或用抗生素殺滅了細菌，才使真菌侵入食管上皮產生壞死的，爛皮樣的假膜，假膜中含有纖維蛋白，壞死組織的碎屑和念珠菌的菌絲體，假膜脫落，黏膜面充血，潰瘍，總之，潰瘍和假膜是特征性所見。
檢查
1.血常規常可發現中性粒細胞減少。
2.血清學試驗測定已感染病人血清凝集滴度有2/3病人高于1∶160；用放免法和酶聯法檢測血清中甘露聚糖抗原(念珠菌細胞壁上的多糖)；用瓊脂凝膠擴散和反向免疫電泳檢測念珠菌抗體；在已感染者血清中抗原及其抗體滴度有1/3迅速升高。
3.食管X線鋇劑檢查對診斷有一定幫助，主要病變在食管的下2/3，可表現為蠕動減弱或彌漫性痙攣，食管黏膜粗亂，不規則或呈顆粒狀，宛如鋇劑內混有多數微小氣泡，晚期病例，黏膜呈結節狀，致使鋇柱外觀如卵石樣，頗似靜脈曲張，有時可顯示深在潰瘍，在慢性病例，炎癥病變向管壁深部發展，可造成節段性狹窄，甚至酷似食管癌，但食管X線鋇劑造影正常并不能排除食管念珠菌病存在。
4.食管鏡檢查是確診該病的惟一方法，鏡下食管黏膜呈現水腫，充血，糜爛，潰瘍，觸之易出血，黏膜表面覆蓋白色斑點或假膜，進行活檢及細胞刷涂片和培養，若培養陽性尚不足以診斷，因念珠菌是胃腸道一種共生菌，必須涂片見有真菌菌絲，活檢組織見有菌絲侵入上皮方可確診。
鑒于念珠菌性食管炎病人多繼發于嚴重的甚至是致命的原發病，因此及時檢查發現，早期作出診斷和進行治療，對挽救病人生命是必要的。