乳腺癌總體遺傳學變異同樣也在非特殊性導管癌中反映，證實對此進行分析或解釋是困難的。隨著腫瘤組織學分級的級別升高（分化程度降低），其遺傳學改變也逐漸累積增加。這一現象支持非特殊性導管癌和浸潤性乳腺癌總體的線性演變模式假說。幾組有關與腫瘤組織學類型或非特殊性導管癌分級相關的特異性遺傳變異的研究結果并不支持上述觀點，提示非特殊性導管癌發生包括一些與遺傳因素無關的腫瘤演變途徑，與特殊的乳腺癌包括小葉癌和小管癌相比顯示了根本的不同。而且，cDNA微陣列分析證明非特殊性導管癌可依據基因表達方式分成亞型。
