1.微創治療（內鏡）
符合內鏡下治療指征的息肉可行內鏡下切除，并將切除標本送病理檢查。
2.手術治療
息肉有惡變傾向或不符合內鏡下治療指征；或內鏡切除后病理發現有殘留病變或癌變。
3.藥物治療
（1）對癥治療如有出血，給以止血，并根據出血量多少進行相應處置。
（2）病因治療潰瘍性結腸炎導致的炎性息肉參見潰瘍性結腸炎的治療
（3）預防治療家族性腺瘤性息肉病（FAP）患者可服用塞來昔布減少腺瘤性結直腸息肉數目，每日兩次，與食物同服。
