化膿性眼內炎能迅速而嚴重地破壞眼組織、損害視功能，如不及時有效地控制炎癥，將會造成視力喪失和眼球萎縮的嚴重后果；若能及早控制，可望保留部分視功能。因此，一旦懷疑為眼內炎，即應積極治療。眼內炎的治療包括藥物治療和手術治療。
1.藥物治療
除了局部應用擴瞳劑如1%阿托品外，主要是選用敏感的抗生素。在沒有確定致病菌和敏感藥物情況下，可先選擇廣譜強力抗生素治療。
2.手術治療
（1）玻璃體腔穿刺注藥術 玻璃體腔內注射抗生素。
（2）玻璃體切割術 可有效去除致病微生物，改變其生存環境，同時能取玻璃體進行檢測。常配合填充硅油治療。