毛細管電泳又稱高效毛細管電泳,是一類以毛細管為分離通道、以高壓直流電場為驅動力的新型液相分離技術。
高效液相色譜是色譜法的一個重要分支，以液體為流動相，采用高壓輸液系統，將具有不同極性的單一溶劑或不同比例的混合溶劑、緩沖液等流動相泵入裝有固定相的色譜柱，在柱內各成分被分離后，進入檢測器進行檢測，從而實現對試樣的分析。
電泳法，是指帶電荷的供試品在惰性支持介質中，于電場的作用下，向其對應的電極方向按各自的速度進行泳動，使組分分離成狹窄的區帶，用適宜的檢測方法記錄其電泳區帶圖譜或計算其含量(%)的方法。
毛細管電泳法和液相法的區別
CE和液相色譜法(HPLC)相比，其相同處在于都是分離技術，儀器操作均可自動化，且二者均有多種不同分離模式。二者之間的差異在于：CE用遷移時間取代HPLC中的保留時間，CE的分析時間通常不超過30min，比HPLC速度快；對CE而言，從理論上推得其理論塔板高度和溶質的擴散系數成正比，對擴散系數小的生物大分子而言，其柱效就要比HPLC高得多；CE所需樣品為nl級，低可達270fl，流動相用量也只需幾毫升，而HPLC所需樣品為μl級，流動相則需幾百毫升乃至更多；但CE僅能實現微量制備，而HPLC可作常量制備。
毛細管電泳法和普通電泳法的區別
CE和普通電泳相比，由于其采用高電場，因此分離速度要快得多；檢測器則除了未能和原子吸收及紅外光譜連接以外，其它類型檢測器均已和CE實現了連接檢測；一般電泳定量精度差，而CE和HPLC相近；CE操作自動化程度比普通電泳要高得多。總之，CE的優點可概括為三高二少：高靈敏度,常用紫外檢測器的檢測限可達10-13～10-15mol,激光誘導熒光檢測器則達10-19～10-21mol；高分辨率，其每米理論塔板數為幾十萬；高者可達幾百萬乃至千萬，而HPLC一般為幾千到幾萬；高速度，快可在60s內完成,在250s內分離10種蛋白質，1.7min分離19種陽離子，3min內分離30種陰離子；樣品少，只需nl(10-9L)級的進樣量；成本低，只需少量(幾毫升)流動相和價格低廉的毛細管。由于以上優點以及分離生物大分子的能力,使CE成為近年來發展迅速的分離分析方法之一。
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