| 實驗步驟 | 一、實驗材料和實驗用品
植物幼嫩組織(如幼葉、花器、幼根等)。
離心機、離心管、紫外分光光度計、微量移液器、吸頭、吸水紙、水浴鍋、冰箱、研缽、液氮罐、電子天平、pH計、高壓滅菌鍋、一次性手套和口罩、電泳儀及電泳槽。
CTAB提取液:2%CTAB(m/V), 100mmol/L Tris-HCl pH8.0, 20mmol/L EDTA pH8.0, 1.4mol/L NaCl, 2% PVP(滅菌后加入2% PVP, 使之充分溶解)。在研磨植物幼嫩組織前加入1%(V/V)β-巰基乙醇。
TE(pH8.0):稱取1.211 g Tris, 0.372 g EDTA-Na2, 先用800 mL蒸餾水加熱攪拌溶解,用鹽酸調pH8.0,再用蒸餾水定容至1000 mL。高壓滅菌20 min。
氯仿/異戊醇(24:1, V/V): 將氯仿和異戊醇按體積24:1的比例混勻,置棕色瓶中,4℃保存。
酚/氯仿/異戊醇(25:24:1): 按飽和酚、氯仿、異戊醇體積比為25:24:1比例混勻,置棕色瓶中,4℃保存。
10 mg/L 的EB貯存液:在100 mL蒸餾水中加入 1g EB, 在磁力攪拌器上攪拌數小時,使其完全溶解,轉至棕色瓶中避光4℃保存。EB是強誘變劑,稱量時要戴手套和口罩。一旦接觸了EB,立即用大量水沖洗。
1X TAE電泳緩沖液:50X TAE濃縮貯存液含Tris堿242 g,冰醋酸57.1 mL, pH8.0 的0.5 mol/L EDTA 100mL, 加600 mL蒸餾水,在磁力攪拌器上攪拌,最后加蒸餾水定容至1000 mL。
6X凝膠加樣緩沖液:0.25%溴酚藍,0.25%二甲苯青FF,40%(m/V)蔗糖水溶液,4℃保存。
3M NaAc(pH5.2)
二、實驗內容和實驗步驟
1.提取DNA
(1)提取DNA所用的提取液、吸頭、離心管等需要在高壓滅菌鍋中121℃(約1.1 kg/cm2)高壓滅菌20 min。
(2)用液氮將50mg 幼嫩葉片研磨成細粉,置于1.5ml 離心管中加入預熱至65℃的600μl 的CTAB提取液,輕搖混勻。
(3)65℃水浴1小時,其間輕搖混勻。
(4)12000rpm離心10min,取上清轉移至另一1.5ml 離心管中。
(5)向上清液中加入等體積的酚/氯仿/異戊醇(25:24:1),輕輕混勻10min,然后12000rpm離心10min,再轉移上清入新管。
(6)向上清液加入等體積的氯仿/異戊醇(24:1),輕輕混勻10min,然后12000rpm離心10min,再轉移上清入新管。
(7)向上清液中加1/10體積的3M NaAC (pH5.2),等體積的冷異丙醇,小心混勻。12000rpm離心10min,棄上清。
(8)用70%乙醇洗滌沉淀一次,12000rpm離心,棄上清。
(10)將沉淀在超凈工作臺上吹干,加50μl TE (pH8.0)室溫溶解。
電泳檢測或用紫外分光光度計檢測DNA的濃度和質量。
2.濃度測定
(1)瓊脂糖電泳法檢測DNA
根據上樣管的數量和電泳槽的大小估算瓊脂糖膠的體積,稱取瓊脂糖干粉用1xTAE緩沖液配制1%的瓊脂糖凝膠,配制時在電爐上加熱使瓊脂糖充分溶解,待溫度降至60℃,加入EB, 使EB的終質量濃度為1 μg/mL,搖勻,倒入帶有梳子的膠床中,避免產生氣泡,室溫下約30 min,膠自然凝固。
把瓊脂糖膠放入電泳槽中,倒入1X TAE電泳緩沖液使液面高出膠面約0.5 cm。
移液器插上10μl吸頭,吸入DNA樣品和上樣緩沖液的混合液后,尖端插入加樣孔底部,緩慢把DNA樣品加入到加樣孔中。
加樣完畢后,正確連接電泳槽和電源,黑線接陰極。紅線接陽極,打開電源,正確設定電壓及時間,時間的選擇取決于膠的長度和電壓大小。一般不高于5 V/cm的電壓,電泳約2 h,待溴酚藍離膠邊約1-1.5cm時停止電泳。
小心取出凝膠,置于紫外透射儀上,紫外燈下檢測擴增片段的有無及分離情況,在凝膠成像儀上照相。
用λDNA做相對分子質量大小的Marker,如果帶型不彌散,在與Marker 20kb 的帶的相應位置出現整齊明亮的條帶,說明基因組DNA完整,沒有降解。
(2)紫外分光光度法測定DNA的濃度
取少量待測的DNA樣品,用TE或蒸餾水稀釋50倍(或100倍)。
用稀釋液做空白,在260 nm、180 nm 、310 nm處調節紫外分光光度計的讀數至零。
加入待測DNA樣品在上述3個波長處讀取OD值。
純DNA樣品的OD260/OD280值大約為1.8,高于1.8有可能有RNA污染,低于1.8有蛋白質污染;
三、實驗結果和計算
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