由于本病病程較長，臨床癥狀不典型，大致可分為8種臨床類型：
（1）橋本甲亢：患者伴發甲亢，部分病例還可有浸潤性突眼、膠前稅液性水腫等。可有典型的甲亢表現。循環抗體滴度較高。這類患者甲亢狀態可持續數年，常需要抗甲狀腺
藥物治療，但劑量不宜過大，要注意藥物性甲減發生。手術切除或放射性核素治療均不適宜，易發生永久性甲減。
（2）假性甲亢：少數患者可有甲亢的臨床表現，如心悸、多汗、神經過敏等，但甲狀腺功能檢查無甲亢證據，TGAb、TMAb陽性。這種病人無需抗甲狀腺藥物治療，癥狀可自行消失。
（3）突眼型：本病可發生浸潤性突眼，其甲狀腺功能可正常、亢進或減退。眶后肌有淋巴細胞浸潤、水腫。血清TGAb和TMAb均為陽性。
（4）類亞急性甲狀腺炎型：少數患者發病較急，伴發熱，甲狀腺迅速增大，伴局部疼痛和壓痛，血沉加快，但攝碘率正常或增高，甲狀腺抗體高滴度限性。
（5）青少年型：青少年甲狀腺腫中，橋本甲狀腺炎約占40%，其甲狀腺較小，甲狀腺功能正常，甲狀腺抗體滴度又較低，臨床診斷較困難。有部分患者甲狀腺腫增大較迅速，稱 青少年增生型。部分患者可合并甲狀腺功能減退。
（6）纖維化型：病程較長的患者，可出現甲狀腺廣泛纖維化。表現為甲狀腺萎縮、甲狀腺功能減退，部分患者纖維化不均勻，出現一部分或一葉致密纖維化病變。局部質控堅 硬，其余部分為典型淋巴細胞浸潤。易誤診為腫瘤。
（7）伴甲狀腺腺瘤或癌：常表現為孤立性結節，TGAb、TMAb滴度較高，結節部為腺瘤或癌的病理改變，其余部分為橋本甲狀腺炎的組織學變化。
（8）伴發其他自身免疫性疾病。可表現為自身免疫性多發性內分泌病。臨床上可有甲減伴發艾迪生病、糖尿病、甲狀分腺功能減退、原發性閉經等。也可伴發其他自身免疫病， 如惡性貧血、重癥肌無力、自身免疫性肝炎、系統性紅斑狼瘡、干燥綜合征、類風濕性關節炎、慢性萎縮性胃炎等。
橋本甲狀腺炎一般不能自行緩解。部分患者臨床癥狀和清理活檢長期不變；有些患者發展為結節性甲狀腺腫；約30%～40%以上患者經過一段穩定期或不知不覺中，發展成為 了永久性甲狀腺功能減退癥； 橋本甲腺炎患者，若甲狀腺功能正常，一般不需要特殊治療；對甲狀腺功能減退者以及病程不長的甲狀腺腫者，應予以甲狀腺激素制劑治療。一般采用干甲狀腺片或左旋甲狀腺素。劑量視病情反應而定，宜從小劑量開始，以后逐漸增加。療程視病情而定，有時需終身服藥。藥物的應用一定要在醫生的指導下進行，否則容易出現甲狀腺中毒現象。