李輝教授PNAS:融合基因組學揭示橫紋肌肉瘤細胞起源

基因融合一直被認為是腫瘤獨有的特征。弗吉尼亞大學的一組研究人員從干細胞肌肉分化發生的融合基因事件入手，分析了橫紋肌肉瘤細胞的起源，這是首次從融合基因的角度來研究腫瘤細胞的起源。

這項研究在線發表于10月31日《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志上，文章的第一作者謝仲秋博士畢業于湖南大學，博士期間從事干細胞轉錄因子研究，目前在佛吉尼亞大學做博士后。

李輝實驗室近幾年在融合基因領域取得了很大進展且受邀在Trends in cancer發表綜述。李輝博士本科畢業于中國科技大學物理化學專業，在美國凱斯西儲大學攻讀生物學博士學位，耶魯大學博士后，目前在弗吉尼亞大學醫學院病理系從事腫瘤研究，獲得過V Scholarship，Stand Up To Cancer Innovator Award，St. Baldrick’s Scholar，The Ivy Foundation Biomedical Innovation Award，American Cancer Society Research Scholar 等多項榮譽。該課題St. Baldrick’s Scholar資助。

基因融合一直被認為是腫瘤獨有的特征。基因融合是指染色體上兩個異位的基因嵌合在一起，這種現象一般是由于染色體發生易位、缺失或者倒置造成的，通常在癌癥的發生發展扮演著重要的角色，并且可以作為診斷和治療癌癥的靶標。基因融合現象最早在慢性粒細胞白血病中 BCR-ABL基因融合。隨著對基因融合的深入研究，科研人員發現，除血液系統腫瘤外，在實體瘤中也存在著基因融合現象，例如橫紋肌肉瘤PAX3-FOXO1,前列腺癌中的TMPRSS2-ERG、小細胞肺癌中的EML4-ALK、結直腸癌中的VTI1A-TCF7L2，等基因融合。

橫紋肌肉瘤（Rhabdomyosarcoma，RMS）是罕見的一種惡性腫瘤，但在小兒實體瘤中發病率較高，其臨床亞型有胚胎型橫紋肌肉瘤（ERMS），腺泡型橫紋肌肉瘤( ARMS)，在80－85%的ARMS中可檢測到特異性染色體易位，兩種易位分別形成相應的融合基因PAX3-FKHR(也稱為PAX3-FOXO1)或PAX7-FOXO1。

最新這項研究結合生物信息學和干細胞生物學，首次從融合基因的角度來研究腫瘤細胞的起源。在MSCs干細胞骨骼肌分化樣品中發現有一個時間點樣品和橫紋肌肉瘤細胞RH30類似的融合基因組，這種瞬時的融合基因組發生事件提供了腫瘤細胞起源的新線索。