電化學工作站在掃描過程中掃描意外停止是因為有的電化學工作站使用的是變壓器，輸入的電壓低于儀器的保護電壓，儀器和微機的通信就會自動斷開；比如我國的單相公共用電是220V，儀器的使用電壓是±20%，那么輸入電壓高于264V，低于176V，儀器就會進入自動保護，工作站和微機的通訊就會自動斷而開掃描停止。如果沒有設置自動保護的，工作站和微機是通的，當電壓很低的時候掃描也不會停止，但邏輯數據已經紊亂了，做出來的圖也沒有意義。當電壓很高或者電流很大時會燒壞電極或者燒毀儀器，所以儀器沒有設置自動保護裝置是非常危險的。
如果進實驗室同一路電源線上有設備使用功率比較大，影響到其他儀器的運行，要考慮使用一個UPS智能高頻在線式交流不間斷電源系統，或者改進供電裝置。