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  • 發布時間:2012-03-08 11:05 原文鏈接: 成都生物所完成脫落酸高產菌株全基因組測序

      3月8日,從中科院成都生物研究所科技處獲悉,在上海人類基因組研究中心的協作下,該所完成了脫落酸高產菌株灰葡萄孢霉(Botrytis cinerea) TBC-A的全基因組測序及分析工作。

      B. cinereaTBC-A是成都生物所經過多年改良篩選及系統研發的、具有自主知識產權的脫落酸高產菌株。研究人員以ROCHE 454 GS FLX (Titanium)和Illumina Solexa高通量測序為基礎,對整個真菌基因組進行測序,分別獲得了20倍和50倍基因組覆蓋率的測序量,由此構建了該基因組序列的精細圖。通過對全基因組的生物信息學分析,預測了大約11000個基因,并注釋了基因功能及參與的代謝網絡。

      B. cinereaTBC-A全基因組測序工作的完成,為研究該菌株高產脫落酸的分子機理奠定了基礎,大大提高了研究的科學性和效率。后續工作擬通過比較轉錄組學以及與國際上已測序的同類菌株全基因組比較分析等方法,研究真菌生物合成脫落酸的關鍵基因及其分子機制。

      該項工作的完成標志著成都生物所“真菌發酵生產脫落酸”的研究進入了一個新的發展階段。

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