免疫抑制藥物與艾滋病的流行使中樞神經系統真菌感染(包括腦膜和腦組織的感染)發病率大為提高.在艾滋病,霍奇金病或淋巴肉瘤病例,以及長期接受大劑量腎上腺皮質激素治療的病例中,最常見的真菌感染是由隱球菌所引起.球孢子菌,毛霉菌,念珠菌,放線菌,組織胞漿菌以及曲霉菌引起的感染較少見.
引起軟腦膜彌漫性浸潤的新生物性腦膜炎是急性淋巴母細胞性白血病中經常遇到的一個難題,特別見于那些接受不能通過血腦屏障的抗白血病藥物治療的兒童病例.在少見情況下,惡性疾病的第一個征象就是亞急性的腦膜炎癥.