山西醫科大學Cell子刊發表最新癌癥成果

　　來自山西醫科大學、中國醫學科學院北京協和醫院、深圳華大基因研究所等機構的研究人員，采用全基因組測序（WGS）揭示出了食管鱗狀細胞癌多樣的結構變異模式。研究論文發表在Cell出版社旗下的子刊《AJHG》雜志上。

　　山西醫科大學的崔永萍（Yongping Cui）教授和中國醫學科學院副院長詹啟敏（Qimin Zhan）院士是這篇論文的共同通訊作者。崔永萍教授主要從事惡性腫瘤的病因學、細胞生物學、遺傳學及基因組學領域的研究工作。詹啟敏院士多年來主要從事腫瘤分子生物學研究，曾在國際上率先發現和系統揭示細胞周期監測點關鍵蛋白的作用和機制，報道抑癌基因p53的最重要生物學功能，并發現第一個p53調控靶基因。

　　食管癌（EC）是人類常見的消化道惡性腫瘤之一，發病率及死亡率分別居世界第8位和第6 位。食管癌主要有2種不同的臨床病理類型：食管鱗癌（ESCC）和食管腺癌（EAC）。全球大約70%的ESCC發生在中國，而太行山區是世界著名的食管鱗癌高發地之一。食管癌的發生除了與吸煙、飲酒、微量元素缺乏、喜燙食等環境高危因素有關外，遺傳變異因素在食管癌的發生發展中起著尤為關鍵的作用。

　　2015年，崔永萍教授和詹啟敏院士合作，采用全基因組測序及全外顯子測序的方法，揭示出了ESCC的一些突變標簽和頻繁突變的基因。為我們提供了關于ESCC突變標簽的全面認識，并鑒別出了一些早期診斷標記物和潛在治療靶點。

　　在這篇新文章中作者們指出，綜合分析體細胞結構變異(SVs)及了解癌癥中的突變機制有可能幫助認識生物學差異及鑒別出一些新的治療靶點。不幸地是，目前很大程度上仍不清楚整個基因組復雜SVs的特征及ESCC的潛在突變機制。

　　為了確定ESCC中體細胞SVs、受累靶基因的綜合目錄及它們潛在的機制，研究人員采用Meerkat算法重新分析了來自31個ESCCs的全基因組測序數據，預測了體細胞SVs和拼接確定了拷貝數改變。他們發現NHEJ和alt-EJ造成的缺失與易位是主要的SV類型，16%的缺失是復雜缺失。 SVs往往會破壞具有不同突變機制的癌癥相關基因（如CDKN2A和NOTCH1)。

　　此外，研究人員確定染色體碎裂（chromothripsis）、kataegis突變和斷裂—融合—橋接(BFB)造成了染色體局部排列錯誤，這種情況發生于55%的ESCCs中。這些基因組災難通過染色體碎裂引起的雙微染色體形成（如FGFR1和LETM2）或受到BFB影響的染色體（如 CCND1, EGFR, ERBB2, MMPs和MYC）造成了癌基因擴增，大約30%的ESCCs包含BFB引起的CCND1擴增。

　　通過分析拷貝數變異，研究人員揭示出了高頻的全基因倍增(WGD)和CDCA7頻發焦點擴增，CDCA7有可能是ESCC中一個潛在的癌基因。研究結果揭示出了在ESCCs惡變中染色體碎裂和BFB一類的分子缺陷，證實在ESCC中存在多種模式的SVs衍生靶基因。這些全基因組SV圖譜及它們的潛在機制對于預防、診斷和治療ESCCs具有重要的意義。

　　近年詹啟敏院士在ESCCs研究中取得不少突破性成果。2014年，詹啟敏院士領導中國醫學科學院、深圳華大基因研究院等機構的研究人員，采用全基因組測序、全外顯子組測序和比較基因組雜交芯片分析等方法，對來自廣東省潮汕地區的158名食管鱗狀細胞癌（ESCC）患者展開研究，鑒別出了這類癌癥的一些基因組改變。這一重要的研究成果發表在Nature雜志上。2015年，在Oncogene雜志上發表文章，揭示了血小板活化因子受體（PAFR）在ESCC惡性演進中發揮的作用。