在臨床實踐中，功血的準確診斷并不容易，有報道一些器質性病變比較隱蔽，病程緩慢，被誤診為功血。診斷功血，第一，要除外器質性病變。器質性病變有很多種，如血小板減少癥，再障血液病，甲低，甲亢，服用性激素，避孕藥，生殖器外傷，異物，異位妊娠，先兆流產，子宮平滑肌瘤和肉瘤、子宮腺肌病、子宮內膜癌、子宮內膜炎、子宮內膜息肉，紅斑狼瘡等。第二，長期功能性失調可能會轉化為器質性，兩者并無絕對界限，如無排卵功血的患者由于受體內高雌激素的影響轉為子宮內膜息肉，子宮內膜癌。臨床多見反復異常子宮出血的患者，早期診刮術后病理是增生期內膜，因未按時復診及正確治療，后期診刮術后病理診斷為子宮內膜癌。第三，導致異常子宮出血的器質性病變和功能性障礙可能并存。功血的患者可能同時患有其他疾病，如功血與內膜炎并存，功血與子宮肌瘤并存，功血與子宮內膜異位癥并存等。
目前輔助檢查功能性子宮出血的手段包括診斷性刮宮、排卵和黃體功能檢測(包括基礎體溫的測定、陰道細胞學和宮頸粘液功能的檢查、激素的測定、超聲檢查)、血液和凝血纖溶功能檢查、肝功能檢查。
功血診斷的要點：應準確地采集病史，詳細詢問月經和出血史，近期服用避孕藥及性激素藥物，判斷不正常月經的出血類型。婦科檢查可排除宮頸疾病、陰道疾病引起的出血，明確子宮腔出血。育齡期婦女檢查人絨毛膜促性腺激素排除妊娠相關疾病。超聲影像學檢查排除生殖系統器質性病變。診斷性刮宮排除子宮內膜增生性疾病或癌前病變。宮腔鏡檢查和子宮內膜活檢是有效的診斷手段。