纖維素酶來源非常廣泛，昆蟲、微生物（細菌、放線菌、真菌等）都能產生纖維素酶，通過微生物發酵方法是大規模制備纖維素酶的有效途徑。不同微生物合成的纖維素酶在組成上有顯著的差異，對纖維素的酶解能力也不大相同。由于放線菌的纖維素酶產量極低，研究很少。
細菌的產量也不高，主要是葡聚糖內切酶，且大多數對結晶纖維素沒有活性，所產生酶是胞內酶或吸附在菌壁上，很少能分泌到細胞外，增加提取純化難度，在工業上很少應用。而絲狀真菌具有產酶諸多優點：產生纖維素酶為胞外酶，便于酶的分離和提取；
產酶效率高，且產生纖維素酶的酶系結構較為合理；同時可產生許多半纖維素酶、果膠酶、淀粉酶等。從纖維素酶工業化制備及其應用角度看，研究和采用絲狀真菌產酶具有更大意義。從目前研究進展來看，里氏木霉同時具有較為穩定性狀、優質高產纖維素酶的能力和較好“抗代謝阻遏”能力，被認為是最具有工業應用價值菌株。