PCR和核酸探針已用于瘧疾的診斷,分子生物學檢測技術的最突出的優點是對低原蟲血癥檢出率較高。
用核酸探針檢測惡性瘧原蟲,其敏感性可達感染紅細胞內0.0001%的原蟲密度。
國內學者采用套式PCR技術擴增間日瘧原蟲 SSU rRNA基因120bp的特定片段,其敏感性達0.1原蟲/μl血。