玻璃體是細菌、微生物極好的生長基，致病菌侵入玻璃體內后可迅速繁殖并引起炎癥反應。眼內炎病理改變的程度與細菌的數量及毒力、機體的免疫功能和治療效果有關。急性期在顯微鏡下表現為中性粒細胞浸潤、滲出及組織壞死。中性粒細胞彌漫性分布于血管周圍，并大量聚集于前房和玻璃體內，在鞏膜穿孔處更密集。若晶體囊膜破裂，致病菌和中性粒細胞可侵入晶狀體，引起晶狀體積膿。在前房、后房和玻璃體內出現蛋白類滲出物，在前房和睫狀體平部形成纖維化膿性結節。壞死的細胞腫脹，失去細胞結構，核固縮、破裂或消失。壞死組織常呈嗜酸性染色。色素顆粒不易被分解破壞，常被巨噬細胞吞噬。角膜中央被毒素或中性粒細胞浸潤后形成環形壞死及穿孔。急性化膿性炎癥消退后，浸潤的中性粒細胞逐漸被單核細胞或淋巴細胞代替。炎癥滲出物逐漸被吸收，常與肉芽組織一起形成纖維瘢痕組織。