（一）指診：
可觸到直腸粘膜彈性減弱，粗糙呈顆粒狀突起或有疤痕。
（二）直腸鏡檢查：
可見粘膜水腫、肥厚，色黃白，被覆粘液，擦去粘液，可見粘膜表面不光滑，個別部位有糜爛。慢性直腸炎鏡檢的特點是：粘膜腫脹、肥厚，表面呈粗糙顆粒、有少量粘液，萎縮性直腸炎鏡下可見：粘膜干燥、色灰白，粘膜下可見血管網。
（三）細菌培養和活體組織檢查，可確定病因診斷。
