（1）幽門螺桿菌近年已證實幽門螺桿菌的胃內感染為主要病因。
（2）十二指腸液反流幽門括約肌功能失調時，使十二指腸液反流入胃增加。十二指腸液中含有膽汁、腸液和胰液，能破壞胃黏膜的正常屏障作用，使慢性胃炎持續存在。
（3）細菌和病毒感染患急性胃炎后一部分患兒胃黏膜病變經久不愈，發展成慢性胃炎；某些患兒鼻竇、口腔等處有感染病灶，吞入其細菌和毒素即引起胃黏膜炎癥。
（4）化學性藥物小兒時期經常感冒和發熱，反復使用非甾體類藥物，使胃黏膜內源性物質前列腺素減少，胃黏膜屏障功能降低，而致胃黏膜損傷。
（5）不合理的飲食習慣食物粗糙、過冷、過熱、過酸、過辣、過咸或經常暴飲暴食、飲濃茶、咖啡、飲食無規律等，均可引起胃黏膜慢性炎癥。食物中缺乏蛋白質、B族維生素也使慢性胃炎的易患性增加。
（6）腹部受涼是兒童胃炎的最常見原因，尤其是在換季時，如果照顧不周，往往引起胃腸型感冒，常見表現就是腹痛腹瀉，如果治療不及時或治療方法不當，病情遷延，就會導致慢性胃炎。
（7）精神神經因素持續精神緊張，壓力過大，心理因素導致的胃炎在幼兒園和小學孩子中最常見，幾乎每天早上發病，休息時癥狀輕，在臨近考試時癥狀加重。
（8）多種慢性病影響如慢性腎炎、尿毒癥、重癥糖尿病、肝膽系統疾病、類風濕性關節炎、系統性紅斑狼瘡等。
（9）其他因素如X線照射、胃內容物滯留、遺傳、免疫、營養等因素均與發病有關。