當兩個轉座子被同一轉座酶識別而整合到染色體的臨近位置時,則它們之間的DNA將變得易于被轉座酶作用而轉座。如果它們之間的DNA中含有外顯子,則該外顯子將被切離,并可能插入另一基因之中。這種效應稱為外顯子混編。
即新的基因是由原來的基因打斷后的斷片混編而成的,或者是由編碼蛋白質結構域的基因片段混編而成。這種基因片段可能就是外顯子,因此稱為外顯子混編。