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  • 發布時間:2021-07-05 15:22 原文鏈接: 全血分離獲得血清的方法及步驟

    材料與方法

    1.1 血清采集 MG患者全血來自2004~2005年就診于遼寧中醫學院附屬醫院的門診患者。根據典型臨床表現、新斯的明試驗、低頻重復電刺激及單纖維肌電圖等確診,無其他自身免疫性疾病,未經其他免疫抑制治療,并參照1994年版《中醫病證診斷療效標準》辨證為脾腎虛型。正常人血清取自同時期健康志愿者。-70 ℃冰箱冷凍保存備用。

    1.2 主要試劑 固相pH梯度干膠條IPG strip(Amersham公司產品, 非線性pH 3~10, 7 cm)。3-〔3-(膽酰胺基丙基)二甲氨基〕丙磺酸鹽{3-〔(3-cholamidopropyl) dimethylamino〕-1-propanesul-fonate, CHAPS},二硫蘇糖醇(DL-dithiothreitol, DTT),三丁基膦(tributyl phosphine, TBP),尿素,硫脲,碘乙酰胺(iodoacetamide, IAA),丙烯酰胺(acrylamide)、甲雙丙烯酰胺(N, N'-methylenebi-sacrylamide),四甲基乙二胺(N, N, N, N-tetram-ethyl-ethylenediamine, TEMED),過硫酰胺(am-monium persulfate, APS),三羥甲基氨基甲烷〔tris (hydroxymethyl) aminomethane〕、甘氨酸(glycine, Gly)和十二烷基磺酸鈉(sodium dodecyl sulfate, SDS)均為Bio-Rad公司產品。瓊脂糖為華美生物公司產品。其他試劑均使用國產分析純試劑。所有溶液均用MilliQ水配制。

    1.3 主要儀器 高速冷凍離心機,德國Eppendorf公司產品;EttanTMIPGphorⅡ,Amersham Biosci-ences公司產品;P-2000分光光度儀,Hitachi公司產品;SE-600電泳儀,Amersham公司產品;純水裝置,Millipore公司產品;GS-710光密度掃描儀,Bio-Rad公司產品;冷卻水循環系統,Cole-Parmer公司產品;Bruker-Daltonics AutoFlex TOF-TOF LIFTMass Spectrometer,美國Bruker-Daltonics公司產品;LCQ Deca XP Plus,美國Thermo Finnigan公司產品。

    1.4 雙向電泳

    1.4.1 血清總蛋白質的提取及定量 血清-70 ℃反復凍融4次后,用Agilent Multiple Affinity Re-moval Column處理去除高豐度蛋白。使用Agilent 5K超濾管進行濃縮除鹽,凍干回收的樣品,-70 ℃保存。用裂解液(9 mol/L 尿素、4% CHAPS、 65 mmol/L DTT和cocktail酶抑制劑)進行復溶,并采用考馬斯亮藍法進行蛋白質定量。

    1.4.2 等電聚焦 自-20 ℃取出的膠條,室溫下平衡10 min,以500 μg上樣量在每份樣本中加入上樣緩沖液(8 mol/L尿素、2% CHAPS、1% Bio-lyte和1% TBP)以及標準蛋白質分子,上樣于泡脹槽中,加入礦物油覆蓋。程序設置如下:30 V 12 h,500 V 1 h,1 000 V 1 h,8 000 V 6 h。恒溫20 ℃。等電聚焦電泳后IPG膠條在平衡液1(Tris-base 50 mol/L 、尿素 6 mol/L、甘油 30%、SDS 2%、溴酚藍0.002%和DTT 100 mg)中于振蕩器上振蕩 15 min; 然后置入平衡液2(成分同平衡液1,用 400 mg 碘乙酰胺代替100 mg DTT)同樣于振蕩器上振蕩15 min。

    1.4.3 SDS-PAGE垂直電泳 采用12.5%的均勻SDS2聚丙烯酰胺凝膠(水23.2 ml,30%丙烯酰胺溶液32.46 ml,1.5 mol/L Tris-HCl緩沖液pH 8.8 20 ml,10% SDS 0.8 ml,10% APS 0.4 ml,TEMED 3.76 μl,膠總體積80 ml)。將平衡后的IPG膠條移至凝膠的上方,膠條一端放入低分子量蛋白質標準,0.5%的瓊脂糖封膠。上下槽加入電極緩沖液(Tris 5 mmol/L,Gly 192 mmol/L和SDS 0.1%)。初始電流為每塊膠40 mA,電泳20 min,然后以每塊膠60 mA電流,直至溴酚藍前沿。

    1.4.4 銀染色 電泳結束后,采用硝酸銀染色法,通過固定,硝酸銀染色,顯影,停顯及脫色,至背景清晰。

    1.5 圖像分析 每個樣品常規進行3次二維電泳,用GS-710光密度掃描儀對電泳后的膠圖分別進行掃描,所得掃描圖像輸入計算機,采用Image-master軟件對圖像進行背景消減、蛋白質點檢測和校正,獲取蛋白質點的位置坐標和表達量等分析。選取 Ratio ≥1.5的蛋白質點認為有差異。所有數據的統計分析均采用SPSS 12.0軟件,統計學分析采用 t 檢驗。

    1.6 基質輔助激光解吸電離-飛行時間質譜分析 用手術刀片切下膠上目標條帶,進行切膠、膠上胰蛋白酶酶解 20 h ,抽提酶解肽段,Zip Tip脫鹽后點樣,行基質輔助激光解吸電離-飛行時間質譜(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)分析(飛行管長2.7 m,加速電壓 20 kV ,反射電壓23 kV)。將第1級質譜得到的肽片段質量指紋圖譜、肽質量指紋圖譜與第2級質譜得到的肽序列信息一起用來檢索蛋白質數據庫,找出匹配的蛋白質。

    1.7 數據庫檢索 將質譜鑒定所得的肽質量指紋譜(peptide mass fingerprinting, PMF)數據于Bio-Works(Thermo Finnigan, San Jose, CA)軟件搜索相應的庫。搜索使用的數據庫為IPI human蛋白庫(SEQUEST結果過濾參數為:當Charge+1,Xcorr≥1.9;當Charge+2,Xcorr≥2.2;當Charge+3,Xcorr≥3.75;其中DelCN≥0.1)以及NCBI上 Homo sapiens的非冗余蛋白庫(redundant data-base)。檢索參數為胰蛋白酶解;氨基酸固定修飾方式為脲甲基半胱氨酸;模式為單同位素峰;肽片斷最大誤差控制在100 ppm;肽片斷最大分子量誤差為±0.5 Da;每個肽允許有1個不完全裂解位點。

    2 結果

    2.1 脾腎虛型重癥肌無力患者血清雙向電泳圖譜 的建立及分析 經2-DE技術及銀染色后,得到了兩組血清的雙向凝膠電泳圖,并于相同的條件下重復實驗3次。在正常對照組細胞蛋白質組雙向電泳圖譜上可觀察到1 463±179個蛋白點,而脾腎虛型重癥肌無力組可見到1 508±89個蛋白點

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