一、即取即用
越純的實驗室用水，越不宜久放，純水對周圍環境物質有較強的溶解能力，純水從系統中取出，然后在用到實驗場所過程中，很容易受到所使用容器的溶出或空氣中的污染物質的污染，進而影響到實驗結果。
即取即用是一種非常重要的觀念，使用前才取水的[即取即用]方式可避免超純水受到環境污染；純水系統與有機溶劑等污染源隔離也是降低環境污染的重要因素。
二、耗材需定期更換
在電阻率值降到標準范圍之前，就需以定期的方式更換耗材，以確保水質。耗材的壽命是有周期的，為防止耗材在物理上或化學上的劣質化影響水質，所以需要定期更換耗材。
三、出水口管理
使用超純水機時，需要減少水在水箱中的保存時間并需保持取水口的潔凈。
四、系統連續運行的重要性
長時間放置的純水會導致水質劣化，創造高度一致性，高穩定性的制水環境很重要，因此，不建議長期停止運行純水設備。