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  • 發布時間:2015-11-03 14:21 原文鏈接: 從被基因測序拯救的兒童案例看測序技術的商業化趨勢

      第一例被基因測序拯救的兒童Nic Volker是世界上第一例被基因測序拯救的人,他喜歡瑜伽、巨輪卡車、游泳、鄉村音樂和西部歌曲。

      “每次跌倒我都爬起來。”

      這句話對于將滿11歲的Nic來說具有特殊的意義:他患有癲癇癥,這會使他毫無預兆地失去肌肉張力,往往一天有100次之多。如果發作時他站著,就會跌倒。

      2009年,Nic 4歲時,醫生對他進行了外顯子組測序,根據他的遺傳背景發現,他的病是因為DNA序列上的一個錯誤導致的。根據這一診斷結果,Volker接受了挽救他生命的臍帶血移植。

      自那以后測序的應用發生了很大的變化。2009年,Nic接受外顯子組測序時,整體花費為75000美元。現在這項費用已經下降到約7000美元,其應用獲得了廣泛的認可,美國國家人類基因組研究所臨床基因組學副主任David Adams表示。

      “過去五年來,保險公司已逐漸開始支付外顯子測序的費用”,Adams說,這也說明了測序是經濟有效的。

      Adams介紹,一項對全國范圍內的專家進行的調查顯示,過去12個月,醫生對10000~20000例患者及其親屬進行了外顯子組測序,這其中約1/4的測序都幫助醫生對疾病做出了診斷。

      “從幫助Nic進行診斷的事例中,可以看到外顯子組測序應用的初步成功,這也促進了它在全國和國外醫療中心的應用”,《1000美元基因組》的作者和自然遺傳學(Nature Genetics)的創始人Kevin Davies說。

      當時,威斯康星醫學院與兒童醫院合作,對NIC進行了測序和分析,從這第一例開始,到現在他們已經對3500多例病人及其親屬進行了測序。目前威斯康星醫學院不僅分析解讀兒童醫院患者的遺傳背景,還與Froedtert醫院、其他州、甚至其他國家的醫院合作。

      DNA測序已取得了顯著的進步在威斯康星兒童醫院,自從對Nic進行測序后,有數百例的病人及其家屬接受了外顯子組測序,遺傳病科的臨時主管Donald Basel介紹。通過對病人及其親屬進行測序,約30%的病例都可以找到病因。

      盡管有成功的個例,DNA測序作為一個臨床工具仍處于起步階段,對 Nic進行測序的Howard Jacob表示。

      “最初在兒童醫院應用時,測序檢測是最后的不得已的選擇,而現在,它的應用時間提前了”,Jacob已在7月時離開了醫學院,成為阿拉巴馬州Hudson Alpha研究院醫學基因組學的執行副總裁。

      但是,該技術仍然過于昂貴,一些情況下,保險公司仍認為沒法證明它對醫療是有幫助的,而不愿支付費用,Jacob解釋,此外還需建立一種方法以證明,通過測序發現的突變實際上是導致病人患病的原因。

      盡管如此,該領域已經取得了顯著的進步,Davies介紹。

      Stephen Kingsmore是圣地亞哥Rady兒童醫院基因組學研究所的負責人,他在26小時內就可以得到重癥監護治療病房(ICU)中嬰兒的測序和分析結果,而當初Nic測序和得到分析結果花了幾個月的時間。

      Davies提出,測序技術在商業應用市場的快速發展,可以從最近兩名著名遺傳學家初創的企業中看出。

      Lee Hood帶領團隊開發了一款自動DNA測序儀,創建了Arivale公司,目的是提供一種根據遺傳分析對個人健康進行指導的訂閱式服務。

      J. Craig Venter曾領導過私人資助的人類基因組測序項目,創建了Human Longevity公司,目前正在建設一個數據庫,這個數據庫將包含年齡相關性退化的遺傳信息和其他醫療信息,這些信息會向客戶開放。

      “他是個小戰士”Nic經受免疫系統紊亂之苦多年,該紊亂會造成腸穿孔,為此,他接受了100多次手術。

      小小的年紀,Nic需要承受的卻太多。他不僅患有癲癇(很可能與腦炎感染相關),還被診斷出創傷后應激障礙(PTSD),正在接受治療。

      “他在醫院時是個小戰士,他的戰場在那里,但回家后,他就變得不一樣了”,他的媽媽Amylynne Volker說。

      Nic的健康問題仍然很棘手,Alan Mayer解釋,他是第一個提出對Nic進行基因測序以明確診斷的醫生。

      “關于他的健康,許多方面需要注意,但他的免疫系統紊亂似乎已經被解決了”,小兒胃腸病學家Mayer說。

      Nic沒有再患腸穿孔,也不需再生活在X-連鎖淋巴組織增生性疾病(XLP)的陰影下。這種通過測序發現的極為罕見的遺傳性疾病只好發于男孩,該病使人免疫力低下,即使是最常見的Epstein-Barr病毒感染,也可能是致命的。

      另一方面,Nic的體重遠遠低于同齡兒童的平均體重,這使Mayer很擔憂。

      他說,“目前他的大部分健康問題都是疾病早期以及免疫系統的損害造成的。

      “關于自己,他非常有見地”如今,Nic忍受著創傷的折磨。他的結腸不得不因為腸道疾病而切除。他的余生里,廢物的排出將依賴于一個特殊的袋子,這不斷提醒著他與同齡人的不同。

      但他不回避生活。他想了解如何學霹靂舞、空手道。他喜歡參加冥想班,它鼓勵人們更多地了解自身的環境、想法、情感和身體感受。

      他媽媽說:“關于自己,他非常有見地。”

      Nic Volker的家人已成立一個網站——gofundme,籌集資金,以幫助解決他的醫療費用。Volker家的發言人Steve Lyons說, “這個家庭每天要應對許多事情,其中之一,就是那些不斷累計的醫療費用。以后,我們會通過gofundme和其他途徑來幫助Volker家應對他們面臨的挑戰,以使這個威斯康辛州的家庭能看到未來。”

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