今年底要測序3000個基因組

1月17日，美國《國家科學院院刊》刊發了一組文章，描述了地球生物基因組計劃（EBP）的目標、迄今的成就和下一步的行動。這意味著旨在繪制地球上所有植物、動物、真菌和其他微生物基因組圖的EBP進入一個新階段，從試點項目轉向全面測序。

“EBP特輯報道了生物學史上最大規模協同工作的本質和激動人心之處。”EBP工作組主席、美國加利福尼亞大學戴維斯分校進化與生態學教授Harris Lewin說，“從基礎科學，到在一系列廣泛緊迫的全球問題上的突破性應用——例如，防止生物多樣性喪失、使糧食作物適應氣候變化，EBP在真核生物測序方面的進展鼓舞人心。現在，我們似乎可以實現對所有真核生物進行測序的最終目標。”

EBP于2018年11月啟動，其目標是提供所有180萬種已命名植物、動物、真菌以及單細胞真核生物的完整DNA序列目錄。建立所有已知真核生物的DNA序列數字庫有助于創造有效工具，來防止生物多樣性喪失和病原體傳播，監測保護生態系統，并加強生態系統服務。

該項目作為一個國際網絡發揮作用，協同許多工作，例如，加利福尼亞保護基因組項目、達爾文生命樹項目、脊椎動物基因組項目等。

2018至2020年是EBP的啟動階段。到2023年，EBP第一階段的目標是產生代表約9400個分類科的參考基因組。迄今已產生大約200個這樣的參考基因組，預計到2022年底將完成3000多個基因組的測序、組裝和注釋，約占第一階段目標的1/3。

截至2021年12月，該項目涉及除南極洲以外各大洲22個國家44個成員機構的5000名科學家和技術人員。目前49個附屬項目涵蓋了主要的真核生物群體，獲得了數以萬計的高質量樣本。